Double-hit Signature with <i>TP53</i> Abnormalities Predicts Poor Survival in Patients with Germinal Center Type Diffuse Large B-cell Lymphoma Treated with R-CHOP
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Purpose: We performed detailed genomic analysis on 87 cases of de novo diffuse large B-cell lymphoma of germinal center type (GCB DLBCL) to identify characteristics that are associated with survival in those treated with R-CHOP (rituximab, cyclophosphamide, doxorubicin, vincristine, and prednisone). Experimental Design: The cases were extensively characterized by combining the results of IHC, cell-of-origin gene expression profiling (GEP; NanoString), double-hit GEP (DLBCL90), FISH cytogenetic analysis for double/triple-hit lymphoma, copy-number analysis, and targeted deep sequencing using a custom mutation panel of 334 genes. Results: We identified four distinct biologic subgroups with different survivals, and with similarities to the genomic classifications from two large retrospective studies of DLBCL. Patients with the double-hit signature, but no abnormalities of TP53, and those lacking EZH2 mutation and/or BCL2 translocation, had an excellent prognosis. However, patients with an EZB-like profile had an intermediate prognosis, whereas those with TP53 inactivation combined with the double-hit signature had an extremely poor prognosis. This latter finding was validated using two independent cohorts. Conclusions: We propose a practical schema to use genomic variables to risk-stratify patients with GCB DLBCL. This schema provides a promising new approach to identify high-risk patients for new and innovative therapies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».