MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3118648163 · doi:10.1101/2020.12.30.424747

<i>De novo</i> germline mutation in the Dual Specificity Phosphatase 10 gene accelerates autoimmune diabetes in Non-Obese Diabetic (NOD) mice

2021· preprint· en· W3118648163 sur OpenAlexaff
Anne‐Perrine Foray, Sophie Candon, Sara Hildebrand, Cindy Marquet, Fabrice Valette, Coralie Pecquet, Sébastien Lemoine, Francina Langa Vives, Michaël Dumas, Peipei Hu, Pere Santamaría, Stephen Lyon, Lindsay Scott, Chun Hui Bu, Tao Wang, Darui Xu, Eva Marie Y. Moresco, Claudio Scazzocchio, Jean‐François Bach, Bruce Beutler, Lucienne Chatenoud

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleLyda Hill Foundation
Mots-clésNodNOD miceBiologyGeneAlleleMutationGermlineSingle-nucleotide polymorphismEndocrinologyGeneticsCancer researchInternal medicineMedicineGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Here we report the isolation by selective breeding of two sublines of Non-Obese Diabetic (NOD) mice exhibiting a significant difference in the incidence of autoimmune type 1 diabetes (T1D). Whole genome sequencing of the NOD/Nck H (high T1D incidence) and NOD/Nck L (low T1D incidence) revealed the presence of a limited number of variants specific to each subline. Treating the age of T1D onset as a quantitative trait and using automated meiotic mapping (AMM), enhanced susceptibility in the NOD/Nck H subline was unambiguously attributed to a recessive allele of Dusp10 which encodes a dual specificity phosphatase. The causative effect of the mutation was verified with a high level of confidence by targeting Dusp10 with CRISPR/Cas9 in NOD/Nck L mice: in these animals a higher incidence of diabetes was observed. Expression of wild-type Dusp10 correlated with higher levels of surface PD-L1 in the islets of NOD/Nck L mice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetPancreatic function and diabetes→Travaux en français237 207→