MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3118831394 · doi:10.1101/2021.01.04.425314

AusTraits – a curated plant trait database for the Australian flora

2021· preprint· en· W3118831394 sur OpenAlexaff
Daniel S. Falster, Rachael V. Gallagher, Elizabeth Wenk, Ian J. Wright, Dony Indiarto, Caitlan Baxter, Samuel C. Andrew, James R. Lawson, Stuart Allen, Anne Fuchs, Mark A. Adams, Collin W. Ahrens, Matthew Alfonzetti, Tara Angevin, Owen K. Atkin, Tony D. Auld, Andrew G. Baker, A. R. Bean, Chris J. Blackman, Keith J. Bloomfield, David M. J. S. Bowman, Jason G. Bragg, Timothy J. Brodribb, Genevieve Buckton, Geoff Burrows, Elizabeth Caldwell, James Camac, Raymond J. Carpenter, Jane A. Catford, Gregory R. Cawthray, Lucas A. Cernusak, Gregory Chandler, Alex R. Chapman, David Cheal, Alexander W. Cheesman, Si‐Chong Chen, Brendan Choat, Brook Clinton, Peta L. Clode, Helen G. Coleman, William K. Cornwell, Meredith Cosgrove, Michael D. Crisp, Erika Cross, Kristine Y. Crous, Saul A. Cunningham, Ellen M. Curtis, Matthew I. Daws, Jane L. DeGabriel, Matthew D. Denton, Ning Dong, Honglang Duan, David H. Duncan, Richard P. Duncan, Marco F. Duretto, John M. Dwyer, C.R. Edwards, Manuel Esperón‐Rodríguez, John R. Evans, Susan E. Everingham, Jennifer Firn, Carlos Roberto Fonseca, Ben J. French, Doug Frood, Jennifer L. Funk, Sonya R. Geange, Oula Ghannoum, Sean M. Gleason, Carl R. Gosper, Emma F. Gray, Philip K. Groom, C. L. Gross, Greg R. Guerin, Lydia K. Guja, Amy K. Hahs, Matthew Tom Harrison, Patrick E. Hayes, Martin L. Henery, Dieter F. Hochuli, Jocelyn Howell, Guomin Huang, Lesley Hughes, John M. Huisman, Jugoslav Ilic, Ashika Jagdish, Daniel Jin, Gregory J. Jordan, Enrique Jurado, Sabine Kasel, Jürgen Kellermann, Michele Kohout, Robert M. Kooyman, Martyna M. Kotowska, Hao Ran Lai, Étienne Laliberté, Hans Lambers, Byron B. Lamont, Robert Lanfear, Frank van Langevelde, Daniel C. Laughlin, Bree-Anne Laugier-Kitchener, Caroline E. R. Lehmann, Andrea Leigh, Michelle R. Leishman, Tanja I. Lenz, Brendan J. Lepschi, James D. Lewis, Felix K. S. Lim, Udayangani Liu, Janice M. Lord, Christopher H. Lusk, Cate Macinnis‐Ng, Hannah McPherson, Anthony Manea, Margaret M. Mayfield, James K. McCarthy, Trevor L. Meers, Marlien van der Merwe, Daniel J. Metcalfe, Per Milberg, Karel Mokany, Angela T. Moles, Ben D. Moore, Nicholas Moore, John W. Morgan, William K. Morris, Annette Muir, Samantha Munroe, Áine Nicholson, Dean Nicolle, Adrienne B. Nicotra, Ülo Niinemets, Tom North, Andrew O’Reilly‐Nugent, Odhran S. O’Sullivan, Brad Oberle, Yusuke Onoda, Mark K. J. Ooi, Colin P. Osborne, Grazyna Paczkowska, Burak K. Pekin, Caio Guilherme Pereira, Catherine Marina Pickering, Melinda Pickup, Laura J. Pollock, Pieter Poot, Jeff R. Powell, Sally A. Power, I. Colin Prentice, Lynda D. Prior, Suzanne M. Prober, Jennifer Read, Victoria Reynolds, Anna E. Richards, Ben Richardson, Michael L. Roderick, Julieta A. Rosell, Maurizio Rossetto, Barbara Lynette Rye, Paul D. Rymer, Michael A. Sams, Gordon D. Sanson, Susanne Schmidt, Ernst‐Detlef Schulze, Kerrie M. Sendall, Steve J. Sinclair, Benjamin Smith, Renee Smith, Fiona M. Soper, Ben Sparrow, Rachel J. Standish, Timothy L. Staples, Guy M. Taseski, Freya Thomas, David T. Tissue, Mark G. Tjoelker, David Y. P. Tng, Kyle W. Tomlinson, Neil C. Turner, Erik J. Veneklaas, Susanna Venn, Peter A. Vesk, Carolyn Vlasveld, Maria S. Vorontsova, Charles R. Warren, Lasantha K. Weerasinghe, Mark Westoby, Matthew White, Nicholas S. G. Williams, Jarrah Wills, Peter G. Wilson, Colin J. Yates, Amy E. Zanne, Kasia Ziemińska

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueSpecies Distribution and Climate Change
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesAustralian Research Data CommonsNSW Department of Planning,Industry and EnvironmentAustralian Research CouncilSoochow UniversityDepartment of Biodiversity, Conservation and AttractionsCentre for Australian National Biodiversity ResearchMacquarie UniversityDepartment of Environment, Land, Water and Planning, State Government of Victoria
Mots-clésTaxonTraitFlora (microbiology)BiologyScope (computer science)EcologyGenusGeographyDatabaseComputer sciencePaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract We introduce the AusTraits database - a compilation of measurements of plant traits for taxa in the Australian flora (hereafter AusTraits). AusTraits synthesises data on 375 traits across 29230 taxa from field campaigns, published literature, taxonomic monographs, and individual taxa descriptions. Traits vary in scope from physiological measures of performance (e.g. photosynthetic gas exchange, water-use efficiency) to morphological parameters (e.g. leaf area, seed mass, plant height) which link to aspects of ecological variation. AusTraits contains curated and harmonised individual-, species- and genus-level observations coupled to, where available, contextual information on site properties. This data descriptor provides information on version 2.1.0 of AusTraits which contains data for 937243 trait-by-taxa combinations. We envision AusTraits as an ongoing collaborative initiative for easily archiving and sharing trait data to increase our collective understanding of the Australian flora.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,694
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0170,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetSpecies Distribution and Climate ChangeTravaux en français237 207