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Enregistrement W3119014572 · doi:10.1002/jev2.12046

Dissemination of <i>Mycobacterium tuberculosis</i> is associated to a <i>SIGLEC1</i> null variant that limits antigen exchange via trafficking extracellular vesicles

2021· article· en· W3119014572 sur OpenAlexaff
Susana Benet, Cristina Gálvez, Francis Drobniewski, Irina Kontsevaya, Lilibeth Arias, Marta Tortajada, Itziar Erkizia, Víctor Urrea, Ruo‐Yan Ong, Marina Luquin, Maeva Dupont, Jakub Chojnacki, Judith Dalmau, Paula Cardona, Olivier Neyrolles, Geanncarlo Lugo‐Villarino, Christel Vérollet, Esther Julián, Hansjakob Furrer, Huldrych F. Günthard, Paul R. Crocker, Gustavo Tapia, Francesc E. Borràs, Jacques Fellay, Paul J. McLaren, Amalio Telenti, Père-Joan Cardona, Bonaventura Clotet, Cristina Vilaplana, Javier Martínez‐Picado, Nuria Izquierdo‐Useros

Notice bibliographique

RevueJournal of Extracellular Vesicles · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversity of ManitobaPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesWellcome Trust
Mots-clésMycobacterium tuberculosisBiologyNull alleleExtracellularNull cellAntigenImmunologyTuberculosisMicrobiologyGeneAlleleCell biologyGeneticsMedicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The identification of individuals with null alleles enables studying how the loss of gene function affects infection. We previously described a non‐functional variant in SIGLEC1 , which encodes the myeloid‐cell receptor Siglec‐1/CD169 implicated in HIV‐1 cell‐to‐cell transmission. Here we report a significant association between the SIGLEC1 null variant and extrapulmonary dissemination of Mycobacterium tuberculosis (Mtb) in two clinical cohorts comprising 6,256 individuals. Local spread of bacteria within the lung is apparent in Mtb‐infected Siglec‐1 knockout mice which, despite having similar bacterial load, developed more extensive lesions compared to wild type mice. We find that Siglec‐1 is necessary to induce antigen presentation through extracellular vesicle uptake. We postulate that lack of Siglec‐1 delays the onset of protective immunity against Mtb by limiting antigen exchange via extracellular vesicles, allowing for an early local spread of mycobacteria that increases the risk for extrapulmonary dissemination.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,063
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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