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Enregistrement W3120837154 · doi:10.1016/j.celrep.2020.108565

MRE11-RAD50-NBS1 Complex Is Sufficient to Promote Transcription by RNA Polymerase II at Double-Strand Breaks by Melting DNA Ends

2021· article· en· W3120837154 sur OpenAlexafffund
Sheetal Sharma, Roopesh Anand, Xuzhu Zhang, Sofia Francia, Flavia Michelini, Alessandro Galbiati, Hannah Williams, Daryl A. Ronato, Jean‐Yves Masson, Eli Rothenberg, Petr Ćejka, Fabrizio d’Adda di Fagagna

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensUniversité LavalHôtel-Dieu de Québec
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesEuropean Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroAgenzia di Ricerca per la Sclerosi Laterale AmiotroficaNational Cancer InstituteSeventh Framework ProgrammeMinistero dell’Istruzione, dell’Università e della RicercaFP7 People: Marie-Curie ActionsFondazione CariploNational Institute of General Medical SciencesFondazione TelethonSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungConsiglio Nazionale delle RicercheFondation SNCFTechnische Universiteit DelftKing Abdullah University of Science and TechnologyAssociation for International Cancer Research
Mots-clésTranscription bubbleRad50Transcription (linguistics)RNA polymerase IIPolymeraseDNARNA polymeraseCell biologyBiologyGeneticsMolecular biologyChemistryRNAComputational biologyRNA-dependent RNA polymeraseTranscription factorDNA-binding proteinGenePromoterGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The MRE11-RAD50-NBS1 (MRN) complex supports the synthesis of damage-induced long non-coding RNA (dilncRNA) by RNA polymerase II (RNAPII) from DNA double-strand breaks (DSBs) by an unknown mechanism. Here, we show that recombinant human MRN and native RNAPII are sufficient to reconstitute a minimal functional transcriptional apparatus at DSBs. MRN recruits and stabilizes RNAPII at DSBs. Unexpectedly, transcription is promoted independently from MRN nuclease activities. Rather, transcription depends on the ability of MRN to melt DNA ends, as shown by the use of MRN mutants and specific allosteric inhibitors. Single-molecule FRET assays with wild-type and mutant MRN show a tight correlation between the ability to melt DNA ends and to promote transcription. The addition of RPA enhances MRN-mediated transcription, and unpaired DNA ends allow MRN-independent transcription by RNAPII. These results support a model in which MRN generates single-strand DNA ends that favor the initiation of transcription by RNAPII.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,138
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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