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Enregistrement W3122770507 · doi:10.11575/prism/38560

Biodegradation of Aromatic Hydrocarbons by Methanogenic Consortia and Groundwater-Associated Microbial Communities

2021· dissertation· en· W3122770507 sur OpenAlexfundno aff
Nicole Taylor

Notice bibliographique

RevuePRISM (University of Calgary) · 2021
Typedissertation
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial bioremediation and biosurfactants
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGenome Canada
Mots-clésBiodegradationGroundwaterEnvironmental scienceEnvironmental chemistryMicrobial population biologyWaste managementChemistryEcologyBiologyBacteriaEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The biodegradation of hydrocarbons is an important environmental process responsible for in situ remediation of crude oil and gas components. Microorganisms of many lineages and redox conditions have been characterized to degrade numerous types of petroleum hydrocarbons, including those with aromatic structures. Alkyl-substituted mono- and polycyclic aromatic hydrocarbons are more chemically reactive than their unsubstituted counterparts, and as such their anaerobic degradation pathways have been studied to varying degrees. Aromatic hydrocarbons require enzymatic functionalization before biodegradation can occur; these activation enzymes and products are often unique to anaerobic reactions, therefore identifying the metabolites produced or the enzymes carrying out these reactions lends evidence to identifying in situ bioremediation of aromatic hydrocarbon contamination. Hydrocarbon biodegradation in the deep subsurface is often associated with methanogenesis. Anaerobic toluene degradation has been extensively studied and has been shown in multiple studies to involve an activation process known as fumarate addition, however methanogenic biodegradation of other alkylbenzenes and polycyclic aromatic hydrocarbons is comparatively poorly understood. In this work, the biodegradation of ethylbenzene and p-xylene was examined in the presence of toluene; p-toluic acid was found as a metabolite of p-xylene biotransformation, but no evidence of fumarate addition to either p-xylene or ethylbenzene were observed. A second methanogenic biodegradation study of naphthalene, 2-methylnaphthalene, and phenanthrene revealed 2-naphthoic acid as the primary metabolite produced by microbial cultures. A third study involved evaluating the use of a trapping device for passively sampling microorganisms from groundwater contaminated with aromatic hydrocarbons; this study showed that the chosen sorptive material did not influence the biodiversity of microbial communities, did not influence the rate of hydrocarbon biodegradation, and the presence of hydrocarbons was correlated to higher biomass recovery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,183
Écart entre enseignants0,175 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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