MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3124703593 · doi:10.59275/j.melba.2021-3581

FlowReg: Fast Deformable Unsupervised Medical Image Registration using Optical Flow

2021· article· en· W3124703593 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Machine Learning for Biomedical Imaging · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueMedical Image Segmentation Techniques
Établissements canadiensToronto Metropolitan UniversityUniversity of TorontoSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchYork UniversityNational Institutes of HealthNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeU.S. Department of Defense
Mots-clésArtificial intelligenceComputer scienceImage registrationPixelComputer visionNeuroimagingAffine transformationSimilarity (geometry)Optical flowPattern recognition (psychology)Deep learningImage (mathematics)Mathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this work we propose FlowReg, a deep learning-based framework that performs unsupervised image registration for neuroimaging applications. The system is composed of two architectures that are trained sequentially: FlowReg-A which affinely corrects for gross differences between moving and fixed volumes in 3D followed by FlowReg-O which performs pixel-wise deformations on a slice-by-slice basis for fine tuning in 2D. FlowReg-A warps the moving volume using gross global parameters to align rotation, scale, shear, and translation to the fixed volume. A correlation loss that encourages global alignment between the moving and the fixed volumes is employed to regress the affine parameters. The deformable network FlowReg-O operates on 2D image slices and is based on the optical flow CNN network that is adapted to neuroimaging with three loss components. The photometric loss minimizes pixel intensity differences, the smoothness loss encourages similar magnitudes between neighbouring vectors, and a correlation loss that is used to maintain the intensity similarity between fixed and moving image slices. The proposed method is compared to four open source registration techniques ANTs, Demons, SE, and Voxelmorph for FLAIR MRI applications. In total, 4643 FLAIR MR imaging volumes (approximately 255,000 image slices) are used from dementia and vascular disease cohorts, acquired from over 60 international centres with varying acquisition parameters. To quantitatively assess the performance of the registration tools, a battery of novel validation metrics are proposed that focus on the structural integrity of tissues, spatial alignment, and intensity similarity. Experimental results show FlowReg (FlowReg-A+O) performs better than iterative-based registration algorithms for intensity and spatial alignment metrics with a Pixelwise Agreement (PWA) of 0.65, correlation coefficient (R) of 0.80, and Mutual Information (MI) of 0.29. Among the deep learning frameworks evaluated, FlowReg-A or FlowReg-A+O provided the highest performance over all but one of the metrics. Results show that FlowReg is able to obtain high intensity and spatial similarity between the moving and the fixed volumes while maintaining the shape and structure of anatomy and pathology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,964
Score d'incertitude au seuil0,558

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle