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Enregistrement W3125735562 · doi:10.1101/2021.01.28.427950

Vasopressin V2 is a promiscuous G protein-coupled receptor that is biased by its peptide ligands

2021· preprint· en· W3125735562 sur OpenAlexafffund
Franziska M. Heydenreich, Bianca Plouffe, Aurélien Rizk, D. Milić, Joris Zhou, Billy Breton, Christian Le Gouill, Asuka Inoue, Michel Bouvier, Dmitry B. Veprintsev

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensUniversité de MontréalInstitute for Research in Immunology and Cancer
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchDiabetes CanadaSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Science Foundation
Mots-clésVasopressinG protein-coupled receptorReceptorAgonistLigand (biochemistry)Functional selectivityG proteinChemistryVasopressin receptorBiologyPeptideCell biologyBiochemistryBiophysicsEndocrinologyAntagonist

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Activation of the G protein-coupled receptors by agonists may result in the activation of one or more G proteins, and in the recruitment of arrestins. The balance of activation of different pathways can be influenced by the ligand. Using BRET-based biosensors, we showed that the vasopressin V2 receptor activates or at least engages many different G proteins across all G protein subfamilies in response to its native agonist arginine vasopressin (AVP). This includes members of the Gi/o and G12/13 families that have not been previously reported. These signalling pathways are also activated by the synthetic peptide desmopressin and natural homologs of AVP, namely oxytocin and the non-mammalian hormone vasotocin. They demonstrated varying degrees of functional selectivity relative to AVP, as quantified using the operational model for quantifying ligand bias. Additionally, we modelled G protein activation as a Michaelis-Menten reaction. This approach provided a complementary way to quantify signalling bias, with an added benefit of clear separation of the effects of ligand affinity from the intrinsic activity of the receptor. These results showed that V2 receptor is not only promiscuous in its ability to engage several G proteins, but also that its signalling profile could be easily biased by small structural changes in the ligand.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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