The Ribosome-Binding Mode of Trichothecene Mycotoxins Rationalizes Their Structure—Activity Relationships
Notice bibliographique
Résumé
Trichothecenes are the most prevalent mycotoxins contaminating cereal grains. Some of them are also considered as the virulence factors of Fusarium head blight disease. However, the mechanism behind the structure-activity relationship for trichothecenes remains unexplained. Filling this information gap is a crucial step for developing strategies to manage this large family of mycotoxins in food and feed. Here, we perform an in-depth re-examination of the existing structures of Saccharomyces cerevisiae ribosome complexed with three different trichothecenes. Multiple binding interactions between trichothecenes and 25S rRNA, including hydrogen bonds, nonpolar pi stacking interactions and metal ion coordination interactions, are identified as important binding determinants. These interactions are mainly contributed by the key structural elements to the toxicity of trichothecenes, including the oxygen in the 12,13-epoxide ring and a double bond between C9 and C10. In addition, the C3-OH group also participates in binding. The comparison of three trichothecenes binding to the ribosome, along with their binding pocket architecture, suggests that the substitutions at different positions impact trichothecenes binding in two different patterns. Moreover, the binding of trichothecenes induced conformation changes of several nucleotide bases in 25S rRNA. This then provides a structural framework for understanding the structure-activity relationships apparent in trichothecenes. This study will facilitate the development of strategies aimed at detoxifying mycotoxins in food and feed and at improving the resistance of cereal crops to Fusarium fungal diseases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».