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Enregistrement W3127123397 · doi:10.1073/pnas.2010632118

The genomics of ecological flexibility, large brains, and long lives in capuchin monkeys revealed with fecalFACS

2021· article· en· W3127123397 sur OpenAlexafffund
Joseph D. Orkin, Michael J. Montague, Daniela Tejada-Martínez, Marc de Manuel, Javier del Campo, Saúl Cheves Hernández, Anthony Di Fiore, Claudia Fontsere, Jason A. Hodgson, Mareike C. Janiak, Lukas F. K. Kuderna, Esther Lizano, Maria Pia Martin, Yoshihito Niimura, George H. Perry, Carmen Soto Valverde, Jia Tang, Wesley C. Warren, João Pedro de Magalhães, Shoji Kawamura, Tomàs Marquès‐Bonet, Roman Krawetz, Amanda Melin

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2021
Typearticle
Langueen
DomainePsychology
ThématiquePrimate Behavior and Ecology
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesAgencia Estatal de InvestigaciónNatural Environment Research CouncilAlberta Children's Hospital Research InstituteCanada Research ChairsDirectorate for Biological SciencesWashington University in St. LouisResearch Councils UKEuropean CommissionComisión Nacional de Investigación Científica y TecnológicaJapan Society for the Promotion of Science LondonCentres de Recerca de CatalunyaSight Research UKJapan Society for the Promotion of ScienceUniversity of LiverpoolBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilMethuselah FoundationGeneralitat de Catalunya
Mots-clésFlexibility (engineering)Adaptation (eye)Evolutionary biologyBiologyGenomicsLongevityBrain sizeGenomeHominidaeEcologyBiological evolutionNeuroscienceGeneGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Through high-depth sequencing of DNA derived from blood, various tissues, and feces via fluorescence-activated cell sorting (fecalFACS) to isolate monkey epithelial cells, we compared genomes of capuchin populations from tropical dry forests and lowland rainforests and identified population divergence in genes involved in water balance, kidney function, and metabolism. Through a comparative genomics approach spanning a wide diversity of mammals, we identified genes under positive selection associated with longevity and brain development. Additionally, we provide a technological advancement in the use of noninvasive genomics for studies of free-ranging mammals. Our intra- and interspecific comparative study of capuchin genomics provides insights into processes underlying local adaptation to diverse and physiologically challenging environments, as well as the molecular basis of brain evolution and longevity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,094
Score d'incertitude au seuil0,397

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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