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Enregistrement W3127215208 · doi:10.1172/jci140105

RNF168 regulates R-loop resolution and genomic stability in BRCA1/2-deficient tumors

2021· article· en· W3127215208 sur OpenAlexafffund
Parasvi S. Patel, Karan Joshua Abraham, Kiran Kumar Naidu Guturi, Marie‐jo Halaby, Zahra Khan, Luís Palomero, Brandon Ho, Shili Duan, Jonathan St‐Germain, Arash Algouneh, Francesca Mateo, Samah El Ghamrasni, Haithem Barbour, Daniel R. Barnes, Jonathan Beesley, Otto Sánchez, Hal K. Berman, Grant W. Brown, El Bachir Affar, Georgia Chenevix‐Trench, Antonis C. Antoniou, C.H. Arrowsmith, Brian Raught, Miguel Ángel Pujana, Karim Mekhail, Anne Hakem, Razqallah Hakem

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Investigation · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensOntario Tech UniversityHôpital Maisonneuve-RosemontToronto General HospitalUniversity Health NetworkUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesInstituto de Salud Carlos IIIAgència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de RecercaCanadian Institutes of Health ResearchMinistero dello Sviluppo EconomicoNational Cancer InstituteUniversity of TorontoCancer Research UKCentres de Recerca de CatalunyaGovernment of CanadaGovernment of OntarioGeneralitat de CatalunyaMinistère du Développement Économique, de l’Innovation et de l’ExportationEuropean Regional Development FundEuropean CommissionU.S. Department of DefenseBreast Cancer Research FoundationPrincess Margaret Cancer FoundationGenome CanadaFondation du cancer du sein du QuébecNational Institutes of HealthTerry Fox FoundationOvarian Cancer Research Fund
Mots-clésGenome instabilityBiologyDNA damageCarcinogenesisDNA repairCancer researchMitotic catastropheGeneticsMutationMutagenesisCancerDNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Germline mutations in BRCA1 and BRCA2 (BRCA1/2) genes considerably increase breast and ovarian cancer risk. Given that tumors with these mutations have elevated genomic instability, they exhibit relative vulnerability to certain chemotherapies and targeted treatments based on poly (ADP-ribose) polymerase (PARP) inhibition. However, the molecular mechanisms that influence cancer risk and therapeutic benefit or resistance remain only partially understood. BRCA1 and BRCA2 have also been implicated in the suppression of R-loops, triple-stranded nucleic acid structures composed of a DNA:RNA hybrid and a displaced ssDNA strand. Here, we report that loss of RNF168, an E3 ubiquitin ligase and DNA double-strand break (DSB) responder, remarkably protected Brca1-mutant mice against mammary tumorigenesis. We demonstrate that RNF168 deficiency resulted in accumulation of R-loops in BRCA1/2-mutant breast and ovarian cancer cells, leading to DSBs, senescence, and subsequent cell death. Using interactome assays, we identified RNF168 interaction with DHX9, a helicase involved in the resolution and removal of R-loops. Mechanistically, RNF168 directly ubiquitylated DHX9 to facilitate its recruitment to R-loop-prone genomic loci. Consequently, loss of RNF168 impaired DHX9 recruitment to R-loops, thereby abrogating its ability to resolve R-loops. The data presented in this study highlight a dependence of BRCA1/2-defective tumors on factors that suppress R-loops and reveal a fundamental RNF168-mediated molecular mechanism that governs cancer development and vulnerability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,265
Score d'incertitude au seuil0,310

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,325
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations72
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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