Isoform-specific functions of Numb in breast cancer progression, metastasis and proteome remodeling
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Deregulated alternative splicing of the endocytic adaptor NUMB resulting in high expression of Exon9in (exon 9-containing) isoforms has been reported in several cancer types. However, the role of Numb isoform expression in tumor progression and the underlying mechanisms remain elusive. Here, we report greater exon 9 inclusion in multiple cancer types including all subtypes of breast cancer, and correlation of higher exon 9 inclusion in patients with worse prognosis. Deletion of Exon9in in breast cancer cells leads to reduced cell growth and a significant decrease of lung metastasis in orthotopic xenograft experiments. Quantitative mass spectrometry revealed downregulation of proteins involved in EMT and ECM organization and remodeling of the endocytic protein network in cells lacking the Exon9in Numb isoforms. Exon 9 deletion also results in reduced surface levels of ITGβ5, and downstream signaling to ERK and SRC, consistent with enhance lysosomal targeting mediated by the remaining Exon9sk (exon 9 skipping) Numb isoforms. SIGNIFICANCE Expression of NUMB Exon9in protein isoforms correlate with worse progression free survival, particularly in breast cancer. Our findings also reveal that Exon9in isoforms promote breast cancer progression by relieving Numb mediated down regulation of integrins and implicate Numb alternative splicing as a progression factor in multiple cancer types.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».