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Enregistrement W3128060044 · doi:10.12688/f1000research.27800.1

Influence of polymorphisms in the vascular endothelial growth factor gene on allograft rejection after kidney transplantation: a meta-analysis

2021· preprint· en· W3128060044 sur OpenAlexaff
Thanee Eiamsitrakoon, Phuntila Tharabenjasin, Noel Pabalan, Hamdi Jarjanazi, Adis Tasanarong

Notice bibliographique

RevueF1000Research · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Transplantation Outcomes and Treatments
Établissements canadiensMinistry of EnvironmentMinistry of the Environment, Conservation and Parks
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismGenotypeBonferroni correctionAlleleTransplantationMedicineInternal medicineKidney transplantationMeta-analysisGastroenterologyOncologyBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Reported associations of allograft rejection in kidney transplant patients with VEGF single nucleotide polymorphisms (SNPs) have been inconsistent between studies, which prompted a meta-analysis to obtain more precise estimates. Methods: Using the PICO elements, kidney transplant patients (P) were compared by genotype data between rejectors (I) and non-rejectors (C) in order to determine the risk of allograft rejection (O) attributed to the VEGF SNPs. Literature search of four databases yielded seven articles. To calculate risks for allograft rejection, four SNPs were examined. Using the allele-genotype model we compared the variant ( var ) with the wild-type ( wt ) and heterozygous ( var - wt ) alleles. Meta-analysis treatments included outlier and subgroup analyses, the latter was based on ethnicity (Indians/Caucasians) and rejection type (acute/chronic). Multiple comparisons were corrected with the Bonferroni test. Results: Five highly significant outcomes (P a < 0.01) survived Bonferroni correction, one of which showed reduced risk for the var allele (OR 0.61, 95% CI 0.45-0.82). The remaining four indicated increased risk for the wt allele where the chronic rejection (OR 2.10, 95% CI 1.36-3.24) and Indian (OR 1.44, 95% CI 1.13-1.84) subgroups were accorded susceptibility status. Conclusions: Risk associations for renal allograft rejection were increased and reduced on account of the wt and var alleles, respectively. These findings could render the VEGF polymorphisms useful in the clinical genetics of kidney transplantation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,036

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0090,039
Bibliométrie0,0030,006
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,346
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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