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Enregistrement W3128446235 · doi:10.1136/gutjnl-2020-323636

Autoimmune susceptibility gene <i>PTPN2</i> is required for clearance of adherent-invasive <i>Escherichia coli</i> by integrating bacterial uptake and lysosomal defence

2021· article· en· W3128446235 sur OpenAlexafffund
Marianne R. Spalinger, Ali Shawki, Pritha Chatterjee, Vinicius Canale, Alina N. Santos, Anica Sayoc-Becerra, Michael Scharl, Michel L. Tremblay, James Borneman, Declan F. McCole

Notice bibliographique

RevueGut · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensMcGill UniversityOccupational Cancer Research Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesHartmann Müller-Stiftung für Medizinische ForschungCrohn's and Colitis FoundationNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesMcGill UniversitySchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésBiologyMicrobiologyImmune systemImmunologyMacrophageInflammationEscherichia coliInflammatory bowel diseaseGeneIn vitroMedicineDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objectives Alterations in the intestinal microbiota are linked with a wide range of autoimmune and inflammatory conditions, including inflammatory bowel diseases (IBD), where pathobionts penetrate the intestinal barrier and promote inflammatory reactions. In patients with IBD, the ability of intestinal macrophages to efficiently clear invading pathogens is compromised resulting in increased bacterial translocation and excessive immune reactions. Here, we investigated how an IBD-associated loss-of-function variant in the protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 ( PTPN2 ) gene, or loss of PTPN2 expression affected the ability of macrophages to respond to invading bacteria. Design IBD patient-derived macrophages with wild-type (WT) PTPN2 or carrying the IBD-associated PTPN2 SNP, peritoneal macrophages from WT and constitutive PTPN2-knockout mice, as well as mice specifically lacking PTPN2 in macrophages were infected with non-invasive K12 Escherichia coli , the human adherent-invasive E. coli (AIEC) LF82 , or a novel mouse AIEC ( m AIEC) strain. Results Loss of PTPN2 severely compromises the ability of macrophages to clear invading bacteria. Specifically, loss of functional PTPN2 promoted pathobiont invasion/uptake into macrophages and intracellular survival/proliferation by three distinct mechanisms: Increased bacterial uptake was mediated by enhanced expression of carcinoembryonic antigen cellular adhesion molecule (CEACAM)1 and CEACAM6 in PTPN2 -deficient cells, while reduced bacterial clearance resulted from defects in autophagy coupled with compromised lysosomal acidification. In vivo, mice lacking PTPN2 in macrophages were more susceptible to m AIEC infection and m AIEC-induced disease. Conclusions Our findings reveal a tripartite regulatory mechanism by which PTPN2 preserves macrophage antibacterial function, thus crucially contributing to host defence against invading bacteria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,804

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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