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Enregistrement W3128592777 · doi:10.1101/2021.01.30.428641

<i>MYC</i> controls metastatic heterogeneity in pancreatic cancer

2021· preprint· en· W3128592777 sur OpenAlexafffund
Ravikanth Maddipati, Robert J. Norgard, Timour Baslan, Komal S. Rathi, Amy X. Zhang, Pichai Raman, Jason R. Pitarresi, Maximilian D. Wengyn, Taiji Yamazoe, Jinyang Li, David Balli, Michael J. LaRiviere, Ian W. Folkert, Ian D. Millstein, Jonathan Bermeo, Erica L. Carpenter, Scott W. Lowe, Christine A. Iacobuzio–Donahue, Faiyaz Notta, Ben Z. Stanger

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic and Hepatic Oncology Research
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesAbramson Cancer CenterAbramson Family Cancer Research InstituteNational Institutes of HealthOntario Institute for Cancer ResearchCanadian Institutes of Health ResearchCancer Research SocietyUniversity of PennsylvaniaMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterCancer Prevention and Research Institute of TexasCancer Research Institute
Mots-clésIntravasationPancreatic cancerCancer researchMetastasisTranscriptomeCancerDownregulation and upregulationPancreatic ductal adenocarcinomaBiologyAdenocarcinomaMedicineGeneInternal medicineGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The degree of metastatic disease varies widely amongst cancer patients and impacts clinical outcomes. However, the biological and functional differences that drive the extent of metastasis are poorly understood. We analyzed primary tumors and paired metastases using a multi-fluorescent lineage-labeled mouse model of pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) – a tumor type where most patients present with metastases. Genomic and transcriptomic analysis revealed an association between metastatic burden and gene amplification or transcriptional upregulation of MYC and its downstream targets. Functional experiments showed that MYC promotes metastasis by recruiting tumor associated macrophages (TAMs), leading to greater bloodstream intravasation. Consistent with these findings, metastatic progression in human PDAC was associated with activation of MYC signaling pathways and enrichment for MYC amplifications specifically in metastatic patients. Collectively, these results implicate MYC activity as a major determinant of metastatic burden in advanced PDAC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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