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Enregistrement W3129170145 · doi:10.1002/humu.24176

TAOK1 is associated with neurodevelopmental disorder and essential for neuronal maturation and cortical development

2021· article· en· W3129170145 sur OpenAlexaff
Geeske M. van Woerden, Melanie Bos, Charlotte de Konink, Ben Distel, Rossella Avagliano Trezza, Natasha Shur, Kristin Barañano, Sonal Mahida, Anna Chassevent, Allison Schreiber, Angelika Erwin, Karen W. Gripp, Fatima Rehman, Saskia Brulleman, Róisín McCormack, Gwynna Geus, Louisa Kalsner, Arthur Sorlin, Ange‐Line Bruel, David A. Koolen, Melissa K. Gabriel, Mari Rossi, David Fitzpatrick, Andrew O.M. Wilkie, Eduardo Calpena, David Johnson, Alice S. Brooks, Marjon A. van Slegtenhorst, Julie Fleischer, Daniel Groepper, Kristin Lindstrom, A. Micheil Innes, Allison Goodwin, Jennifer B. Humberson, Amanda Noyes, Katherine G. Langley, Aida Telegrafi, Amy Blevins, Jessica F. Hoffman, María J. Guillen Sacoto, Jane Juusola, Kristin G. Monaghan, Sumit Punj, Marleen Simon, Rolph Pfundt, Ype Elgersma, Tjitske Kleefstra

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilHorizon 2020 Framework ProgrammeNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekEuropean CommissionZonMwNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésBiologyBrain developmentNeuroscienceNeurodevelopmental disorderGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Thousand and one amino-acid kinase 1 (TAOK1) is a MAP3K protein kinase, regulating different mitogen-activated protein kinase pathways, thereby modulating a multitude of processes in the cell. Given the recent finding of TAOK1 involvement in neurodevelopmental disorders (NDDs), we investigated the role of TAOK1 in neuronal function and collected a cohort of 23 individuals with mostly de novo variants in TAOK1 to further define the associated NDD. Here, we provide evidence for an important role for TAOK1 in neuronal function, showing that altered TAOK1 expression levels in the embryonic mouse brain affect neural migration in vivo, as well as neuronal maturation in vitro. The molecular spectrum of the identified TAOK1 variants comprises largely truncating and nonsense variants, but also missense variants, for which we provide evidence that they can have a loss of function or dominant-negative effect on TAOK1, expanding the potential underlying causative mechanisms resulting in NDD. Taken together, our data indicate that TAOK1 activity needs to be properly controlled for normal neuronal function and that TAOK1 dysregulation leads to a neurodevelopmental disorder mainly comprising similar facial features, developmental delay/intellectual disability and/or variable learning or behavioral problems, muscular hypotonia, infant feeding difficulties, and growth problems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,887
Score d'incertitude au seuil0,483

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations65
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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