Sensitive protein misfolding cyclic amplification of sporadic Creutzfeldt–Jakob disease prions is strongly seed and substrate dependent
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Unlike variant Creutzfeldt–Jakob disease prions, sporadic Creutzfeldt–Jakob disease prions have been shown to be difficult to amplify in vitro by protein misfolding cyclic amplification (PMCA). We assessed PMCA of pathological prion protein (PrPTSE) from 14 human sCJD brain samples in 3 substrates: 2 from transgenic mice expressing human prion protein (PrP) with either methionine (M) or valine (V) at position 129, and 1 from bank voles. Brain extracts representing the 5 major clinicopathological sCJD subtypes (MM1/MV1, MM2, MV2, VV1, and VV2) all triggered seeded PrPTSE amplification during serial PMCA with strong seed- and substrate-dependence. Remarkably, bank vole PrP substrate allowed the propagation of all sCJD subtypes with preservation of the initial molecular PrPTSE type. In contrast, PMCA in human PrP substrates was accompanied by a PrPTSE molecular shift during heterologous (M/V129) PMCA reactions, with increased permissiveness of V129 PrP substrate to in vitro sCJD prion amplification compared to M129 PrP substrate. Combining PMCA amplification sensitivities with PrPTSE electrophoretic profiles obtained in the different substrates confirmed the classification of 4 distinct major sCJD prion strains (M1, M2, V1, and V2). Finally, the level of sensitivity required to detect VV2 sCJD prions in cerebrospinal fluid was achieved.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».