MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3130279262 · doi:10.1021/jacs.0c12955

The Emergence of RNA from the Heterogeneous Products of Prebiotic Nucleotide Synthesis

2021· review· en· W3130279262 sur OpenAlexfundno aff
Seohyun Chris Kim, Derek K. O’Flaherty, Constantin Giurgiu, Lijun Zhou, Jack W. Szostak

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2021
Typereview
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueOrigins and Evolution of Life
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDivision of ChemistryCanadian Institutes of Health ResearchSimons FoundationHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésNucleotideOligonucleotideChemistryRNANucleobaseNucleic acidBiochemistryStereochemistryCombinatorial chemistryComputational biologyDNABiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent advances in prebiotic chemistry are beginning to outline plausible pathways for the synthesis of the canonical ribonucleotides and their assembly into oligoribonucleotides. However, these reaction pathways suggest that many noncanonical nucleotides are likely to have been generated alongside the standard ribonucleotides. Thus, the oligomerization of prebiotically synthesized nucleotides is likely to have led to a highly heterogeneous collection of oligonucleotides comprised of a wide range of types of nucleotides connected by a variety of backbone linkages. How then did relatively homogeneous RNA emerge from this primordial heterogeneity? Here we focus on nonenzymatic template-directed primer extension as a process that would have strongly enriched for homogeneous RNA over the course of multiple cycles of replication. We review the effects on copying the kinetics of nucleotides with altered nucleobase and sugar moieties, when they are present as activated monomers and when they are incorporated into primer and template oligonucleotides. We also discuss three variations in backbone connectivity, all of which are nonheritable and regenerate native RNA upon being copied. The kinetic superiority of RNA synthesis suggests that nonenzymatic copying served as a chemical selection mechanism that allowed relatively homogeneous RNA to emerge from a complex mixture of prebiotically synthesized nucleotides and oligonucleotides.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations61
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the American Chemical SocietyMême sujetOrigins and Evolution of LifeTravaux en français237 207