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Enregistrement W3130928990 · doi:10.1371/journal.pmed.1003536

Vitamin D levels and risk of type 1 diabetes: A Mendelian randomization study

2021· article· en· W3130928990 sur OpenAlexafffund
Despoina Manousaki, Adil Harroud, Ruth E. Mitchell, Stephanie Ross, Vincenzo Forgetta, Nicholas J. Timpson, George Davey Smith, Constantin Polychronakos, J. Brent Richards

Notice bibliographique

RevuePLoS Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVitamin D Research Studies
Établissements canadiensCentre for Interdisciplinary Research in RehabilitationJewish General HospitalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineMcMaster UniversityMcGill UniversityImpactUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute for Health and Care ResearchFonds de Recherche du Québec - SantéNational Multiple Sclerosis SocietyUniversity of BristolMultiple Sclerosis Society of CanadaUniversity Hospitals Bristol NHS Foundation TrustCancer Research UKMultiple Sclerosis SocietyWellcome TrustJuvenile Diabetes Research Foundation Canada
Mots-clésMendelian randomizationType 2 diabetesSingle-nucleotide polymorphismMedicineVitamin D and neurologyGenome-wide association studyOdds ratioMeta-analysisInternal medicineDiabetes mellitusOncologyGeneticsBiologyEndocrinologyGenotypeGenetic variantsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Vitamin D deficiency has been associated with type 1 diabetes in observational studies, but evidence from randomized controlled trials (RCTs) is lacking. The aim of this study was to test whether genetically decreased vitamin D levels are causally associated with type 1 diabetes using Mendelian randomization (MR). METHODS AND FINDINGS: For our two-sample MR study, we selected as instruments single nucleotide polymorphisms (SNPs) that are strongly associated with 25-hydroxyvitamin D (25OHD) levels in a large vitamin D genome-wide association study (GWAS) on 443,734 Europeans and obtained their corresponding effect estimates on type 1 diabetes risk from a large meta-analysis of 12 type 1 diabetes GWAS studies (Ntot = 24,063, 9,358 cases, and 15,705 controls). In addition to the main analysis using inverse variance weighted MR, we applied 3 additional methods to control for pleiotropy (MR-Egger, weighted median, and mode-based estimate) and compared the respective MR estimates. We also undertook sensitivity analyses excluding SNPs with potential pleiotropic effects. We identified 69 lead independent common SNPs to be genome-wide significant for 25OHD, explaining 3.1% of the variance in 25OHD levels. MR analyses suggested that a 1 standard deviation (SD) decrease in standardized natural log-transformed 25OHD (corresponding to a 29-nmol/l change in 25OHD levels in vitamin D-insufficient individuals) was not associated with an increase in type 1 diabetes risk (inverse-variance weighted (IVW) MR odds ratio (OR) = 1.09, 95% CI: 0.86 to 1.40, p = 0.48). We obtained similar results using the 3 pleiotropy robust MR methods and in sensitivity analyses excluding SNPs associated with serum lipid levels, body composition, blood traits, and type 2 diabetes. Our findings indicate that decreased vitamin D levels did not have a substantial impact on risk of type 1 diabetes in the populations studied. Study limitations include an inability to exclude the existence of smaller associations and a lack of evidence from non-European populations. CONCLUSIONS: Our findings suggest that 25OHD levels are unlikely to have a large effect on risk of type 1 diabetes, but larger MR studies or RCTs are needed to investigate small effects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,052
Score d'incertitude au seuil0,900

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations93
Publié2021
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