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Enregistrement W3131299813 · doi:10.21203/rs.3.rs-189660/v1

TpIRT1 is a transition metal transporter in Polish Wheat (Triticum polonicum L.) with a broad substrate specificity

2021· preprint· en· W3131299813 sur OpenAlexaff
Yulin Jiang, Xing Chen, Songyue Chai, Huajin Sheng, Lina Sha, Xing Fan, Jian Zeng, Houyang Kang, Haiqin Zhang, Xue Xiao, Yonghong Zhou, Olena K. Vatamaniuk, Yi Wang

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Micronutrient Interactions and Effects
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNational Institute of Food and AgricultureGuizhou UniversitySichuan Agricultural UniversityNational Natural Science Foundation of ChinaU.S. Department of Agriculture
Mots-clésArabidopsisYeastProtoplastBiologyPloidyArabidopsis thalianaCommon wheatGenomeBotanyGeneticsGeneMutantChromosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Aims (1) Explore the metal substrate specificity of homologous TpIRT1A and TpIRT1B transporters from dwarf Polish wheat by expressing them in protoplast, yeast, and transgenic Arabidopsis ; (2) screen polymorphic residues of IRT1 homologs from tetraploid and diploid ancestral wheat species that change the substrate specificity. Methods Two IRT1 homoeologs were isolated from A ( TpIRT1A ) and B ( TpIRT1B ) genomes of a tetraploid crop, polish wheat ( Triticum polonicum ). Both of them were analysed by expressing them in yeast and Arabidopsis protoplast, respectively. Then we constructed over-expressing transgenic plants of TpIRT1B for metals property analysis in Arabidopsis. We also isolated 22 IRT1 homoeologs from tetraploid and diploid ancestral wheat species and expressed them in yeast for function analysis. Results Our data highlighted the importance of TpIRT1 in the uptake and translocation of Fe, Mn, Co, and Cd with direct implications for wheat yield potential. Both TpIRT1A and TpIRT1B were located at the plasma membrane and internal vesicles in Arabidopsis protoplasts, and responsible for Cd and Co sensitivity in yeast. The over-expression of TpIRT1B in A. thaliana increased Fe, Mn, Co, and Cd concentration in its tissues and improved plant growth under Fe, Mn, and Co deficiencies, while causing more sensitivity to Cd than wild-type plant. Functional analysis of IRT1 homoeologs from tetraploid and diploid ancestral wheat species in yeast disclosed four distinct amino acid residues in TdiIRT1B ( T. dicoccum ) and TtuIRT1B ( T. turgidum ). Altogether, these results increase the knowledge of IRT1 function in a global crop, wheat.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,793
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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