Cervical Squamous Intraepithelial Lesions are Associated with Changes in the Vaginal Microbiota of Mexican Women
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Cervical cancer is an important health concern worldwide and is one of the leading causes of deaths in Mexican women. Previous studies have shown changes in the female genital tract microbe community related to Human Papillomavirus (HPV) infection and cervical cancer, yet this link remains unexplored in many human populations. This study evaluated the vaginal bacterial community among Mexican women with pre-cancerous Squamous Intraepithelial Lesions (SIL). We sequenced the V3 region of the 16S rRNA gene (Illumina Miseq) in cervical samples from 300 Mexican women, including 157 patients with SIL, most of which were HPV positive, and 143 healthy women without HPV infection or SIL. Beta-diversity analysis showed that 14.6% of the variance in vaginal bacterial community structure is related to the presence of SIL. Presence of SIL was also associated with a higher species richness (Chao 1). MaAsLiN analysis yielded independent associations between SIL/HPV status and an increase in the relative abundance Brachybacterium conglomeratum , as well as a decrease in Sphingobium yanoikuyae and Lactobacillus spp. We also identified independent associations between HPV-16, the most common HPV subtype linked to SIL, and Brachybacterium conglomeratum . Our work indicates that the presence of SIL and HPV infection is associated with important changes in the vaginal microbiome, some of which may be specific to this human population. IMPORTANCE HPV plays a critical role in cervical carcinogenesis but is not sufficient for cervical cancer development, indicating involvement of other factors. Vaginal microbiota is an important factor in controlling infections caused by HPV and depending on its composition it can modulate the microenvironment in vaginal mucosa against viral infection. Ethnic and sociodemographic factors influence differences in vaginal microbiome composition, which underlies the dysbiotic patterns linked to HPV infection and cervical cancer across different women populations. Here, we provide evidence for associations between vaginal microbiota patterns and HPV infection, linked to ethnic and sociodemographic factor. To our knowledge, this is the first report of Brevibacterium aureum and Brachybacterium conglomeratum species linked to HPV infection or SIL.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».