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Enregistrement W3131502825 · doi:10.1038/s41419-021-03491-4

Distinct Ring1b complexes defined by DEAD-box helicases and EMT transcription factors synergistically enhance E-cadherin silencing in breast cancer

2021· article· en· W3131502825 sur OpenAlexfundno aff
Yawei Wang, Yingying Sun, Chao Shang, Lili Chen, Hongyu Chen, Dake Wang, Xianlu Zeng

Notice bibliographique

RevueCell Death and Disease · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsNational Natural Science Foundation of ChinaUniversity of BristolNortheast Normal University
Mots-clésEpigeneticsEpithelial–mesenchymal transitionCancer researchTranscription factorCDH1Gene silencingCadherinBiologyBreast cancerMetastasisCell biologyCancerBioinformaticsCellGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ring1b is a core subunit of polycomb repressive complex 1 (PRC1) and is essential in several high-risk cancers. However, the epigenetic mechanism of Ring1b underlying breast cancer malignancy is poorly understood. In this study, we showed increased expression of Ring1b promoted metastasis by weakening cell-cell adhesions of breast cancer cells. We confirmed that Ring1b could downregulate E-cadherin and contributed to an epigenetic rewiring via PRC1-dependent function by forming distinct complexes with DEAD-box RNA helicases (DDXs) or epithelial-mesenchymal transition transcription factors (EMT TFs) on site-specific loci of E-cadherin promoter. DDXs-Ring1b complexes moderately inhibited E-cadherin, which resulted in an early hybrid EMT state of epithelial cells, and EMT TFs-Ring1b complexes cooperated with DDXs-Ring1b complexes to further repress E-cadherin in mesenchymal-like cancer cells. Clinically, high expression of Ring1b with DDXs or EMT TFs predicted low levels of E-cadherin, metastatic behavior, and poor prognosis. These findings provide an epigenetic regulation mechanism of Ring1b complexes in E-cadherin expression. Ring1b complexes may be potential therapeutic targets and biomarkers for diagnosis and prognosis in invasion breast cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,376
Score d'incertitude au seuil0,580

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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