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Enregistrement W3131835505 · doi:10.1016/j.jaip.2021.02.059

Cluster Analysis of Inflammatory Biomarker Expression in the International Severe Asthma Registry

2021· article· en· W3131835505 sur OpenAlexaff
Eve Denton, David Price, Trung N. Tran, Giorgio Walter Canonica, Andrew Menzies‐Gow, J. Mark FitzGerald, Mohsen Sadatsafavi, Luis Pérez de Llano, George Christoff, Anna Quinton, Chin Kook Rhee, Guy Brusselle, Charlotte Suppli Ulrik, Njira Lugogo, Fiona Hore‐Lacy, Isha Chaudhry, Lakmini Bulathsinhala, Ruth Murray, Victoria Carter, Mark Hew

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Allergy and Clinical Immunology In Practice · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAsthma and respiratory diseases
Établissements canadiensVancouver Coastal HealthVancouver Coastal Health Research InstituteUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesEfficacy and Mechanism Evaluation ProgrammeSanofi GenzymePfizerAKL Research and DevelopmentRegeneron PharmaceuticalsTeva Pharmaceutical IndustriesSanofiHealth Technology Assessment ProgrammeAstraZenecaAmgenMylanGlaxoSmithKline
Mots-clésMedicineAsthmaBiomarkerCluster (spacecraft)Internal medicineOncologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Allergy, eosinophilic inflammation, and epithelial dysregulation are implicated in severe asthma pathogenesis. OBJECTIVE: We characterized biomarker expression in adults with severe asthma. METHODS: Within the International Severe Asthma Registry (ISAR), we analyzed data from 10 countries in North America, Europe, and Asia, with prespecified thresholds for biomarker positivity (serum IgE ≥ 75 kU/L, blood eosinophils ≥ 300 cells/μL, and FeNO ≥ 25 ppb), and with hierarchical cluster analysis using biomarkers as continuous variables. RESULTS: ) predicted 72% ± 20%. By prespecified thresholds, 59% were IgE positive, 57% eosinophil positive, and 58% FeNO positive. There was substantial inflammatory biomarker overlap; 59% were positive for either 2 or 3 biomarkers. Five distinct clusters were identified: cluster 1 (61%, low-to-medium biomarkers) comprised highly symptomatic, older females with elevated BMI and frequent exacerbations; cluster 2 (18%, elevated eosinophils and FeNO) older females with lower BMI and frequent exacerbations; cluster 3 (14%, extremely high FeNO) older, highly symptomatic, lower BMI, and preserved lung function; cluster 4 (6%, extremely high IgE) younger, long duration of asthma, elevated BMI, and poor lung function; cluster 5 (1.2%, extremely high eosinophils) younger males with low BMI, poor lung function, and high burden of sinonasal disease and polyposis. CONCLUSIONS: There is significant overlap of biomarker positivity in severe asthma. Distinct clusters according to biomarker expression exhibit unique clinical characteristics, suggesting the occurrence of discrete patterns of underlying inflammatory pathway activation and providing pathogenic insights relevant to the era of monoclonal biologics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,358
Écart entre enseignants0,334 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations117
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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