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Enregistrement W3134232995 · doi:10.1186/s42523-021-00123-2

Effect of maternal separation and transportation stress on the bovine upper respiratory tract microbiome and the immune response to resident opportunistic pathogens

2021· article· en· W3134232995 sur OpenAlexaff
Nilusha Malmuthuge, Angela Howell, Natasa Arsic, Tracy Prysliak, José Perez‐Casal, Philip Griebel

Notice bibliographique

RevueAnimal Microbiome · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensSaskatchewan Health AuthorityUniversity of SaskatchewanAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésWeaningMicrobiomeBovine respiratory diseaseBiologyRespiratory tractImmune systemRespiratory systemImmunologyAntibodyPhysiologyMicrobiologyAnimal science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The bovine upper respiratory tract (URT) microbiome includes opportunistic pathogens that cause respiratory disease and stress associated with maternal separation and transportation contributes to the severity of this respiratory disease. Stress is known to alter the gut microbiome but little is known regarding the effect of stress on the URT microbiota. This study used six-month old suckling beef calves to investigate whether maternal separation (weaned), by itself or combined with transportation (weaned + transport), altered the URT microbiome and host immune responses to resident opportunistic pathogens. RESULTS: Taxonomic and functional composition of the URT microbiome in suckling and weaned beef calves did not change significantly when serially sampled over a one-month period. Subtle temporal changes in the URT microbiome composition were observed in weaned + transport calves. Total bacterial density was lower (p < 0.05) on day 4 post-weaning in both the weaned and weaned + transport groups when compared to suckling calves. In addition, significant (p < 0.05) temporal changes in the density of the opportunistic pathogens, M. haemolytica and P. multocida, were observed independent of treatment but these changes did not correlate with significantly increased (p < 0.05) serum antibody responses to both of these bacteria in the weaned and weaned + transport groups. Serum antibody responses to My. bovis, another opportunistic pathogen, remained unchanged in all treatment groups. Weaning, by itself and in combination with transportation, also had significant (p < 0.05) short- (2 to 8 days post-weaning) and long-term (28 days post-weaning) effects on the expression of adrenergic receptor genes in blood leukocytes when compared to age-matched suckling beef calves. CONCLUSIONS: Maternal separation (weaning) and transportation has minor effects on the taxonomic and functional composition of the URT microbiome and temporal changes in the density of opportunistic pathogen residing in the URT did not correlate with significant changes in immune responses to these bacteria. Significant changes in adrenergic receptor expression in blood leukocytes following weaning, with or without transportation, suggests altered neuroimmune regulation should be further investigated as a mechanism by which stress can alter host-microbiome interactions for some opportunistic respiratory pathogens that reside in the URT.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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