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Enregistrement W3134419041 · doi:10.1002/sctm.20-0520

Persistence of CRISPR/Cas9 Gene Edited Hematopoietic Stem Cells Following Transplantation: A Systematic Review and Meta-Analysis of Preclinical Studies

2021· review· en· W3134419041 sur OpenAlexaff
Harinad B. Maganti, Adrian Bailey, Aidan M. Kirkham, Risa Shorr, Nicolas Pineault, David Allan

Notice bibliographique

RevueStem Cells Translational Medicine · 2021
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensUniversity of OttawaCanadian Blood ServicesOttawa Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCRISPRBiologyStem cellHaematopoiesisGenome editingTransplantationGenetic enhancementProgenitor cellImmunologyGeneGeneticsMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gene editing blood-derived cells is an attractive approach to cure selected monogenic diseases but remains experimental. A systematic search of preclinical controlled studies is needed to determine the persistence of edited cells following reinfusion. All studies identified in our systematic search (to 20 October 2020) examining the use of CRISPR/Cas9 gene editing in blood-derived cells for transplantation were included. Meta-analysis was performed to determine the engraftment and persistence of gene edited cells. A total of 3538 preclinical studies were identified with 15 published articles meeting eligibility for meta-analysis. These in vivo animal studies examined editing of hemoglobin to correct sickle cell disease (eight studies), inducing resistance to acquired immunodeficiency syndrome (two studies), and six other monogenic disorders (single studies). CRISPR-Cas9 edited hematopoietic stem and progenitor cells demonstrated equivalent early engraftment compared to controls in meta-analysis but persistence of gene-edited cells was reduced at later time points and in secondary transplant recipients. Subgroup analysis in studies targeting the hemoglobin gene revealed a significant reduction in the persistence of gene-edited cells whether homology-directed repair or nonhomologous end-joining were used. No adverse side effects were reported. Significant heterogeneity in study design and outcome reporting was observed and the potential for bias was identified in all studies. CRISPR-Cas9 gene edited cells engraft similarly to unedited hematopoietic cells. Persistence of gene edited cells, however, remains a challenge and improved methods of targeting hematopoietic stem cells are needed. Reducing heterogeneity and potential risk of bias will hasten the development of informative clinical trials.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,016
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,042
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,083

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0160,042
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0140,019
Bibliométrie0,0090,011
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,120
Tête enseignante GPT0,406
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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