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Enregistrement W3135185765 · doi:10.2196/21547

Implementation of the COVID-19 Vulnerability Index Across an International Network of Health Care Data Sets: Collaborative External Validation Study

2021· article· en· W3135185765 sur OpenAlexvenueno aff
Jenna Reps, Chungsoo Kim, Ross D. Williams, Aniek F. Markus, Cynthia Yang, Talita Duarte‐Salles, Thomas Falconer, Jitendra Jonnagaddala, Andrew E. Williams, Sergio Fernández‐Bertolín, Scott L. DuVall, Kristin Kostka, Gowtham Rao, Azza Shoaibi, Anna Ostropolets, Henry M. Spotnitz, Lin Zhang, Paula Casajust, Ewout W. Steyerberg, Fredrik Nyberg, Benjamin Skov Kaas‐Hansen, Young Hwa Choi, Daniel R. Morales, Siaw‐Teng Liaw, Maria Tereza Fernandes Abrahão, Carlos Areia, Michael E. Matheny, Kristine E. Lynch, María Aragón, Rae Woong Park, George Hripcsak, Christian Reich, Marc A. Suchard, Seng Chan You, Patrick Ryan, Daniel Prieto‐Alhambra, Peter R. Rijnbeek

Notice bibliographique

RevueJMIR Medical Informatics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 Clinical Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJanssen Research and DevelopmentNational Institutes of HealthInnovative Medicines InitiativeNovo Nordisk FondenMinistry of Trade, Industry and EnergyNovo NordiskKorea Health Industry Development InstituteNational Institute for Health and Care ResearchGeneralitat de CatalunyaUniversity of OxfordDirecció General de Recerca, Generalitat de CatalunyaEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsU.S. National Library of MedicineU.S. Department of Veterans AffairsUniversity of New South WalesWellcome TrustInnovationsfondenEuropean CommissionNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)2019-20 coronavirus outbreakIndex (typography)Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Vulnerability (computing)Computer scienceMedicineMedical emergencyData scienceComputer securityVirologyOutbreakWorld Wide Web

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: SARS-CoV-2 is straining health care systems globally. The burden on hospitals during the pandemic could be reduced by implementing prediction models that can discriminate patients who require hospitalization from those who do not. The COVID-19 vulnerability (C-19) index, a model that predicts which patients will be admitted to hospital for treatment of pneumonia or pneumonia proxies, has been developed and proposed as a valuable tool for decision-making during the pandemic. However, the model is at high risk of bias according to the "prediction model risk of bias assessment" criteria, and it has not been externally validated. OBJECTIVE: The aim of this study was to externally validate the C-19 index across a range of health care settings to determine how well it broadly predicts hospitalization due to pneumonia in COVID-19 cases. METHODS: We followed the Observational Health Data Sciences and Informatics (OHDSI) framework for external validation to assess the reliability of the C-19 index. We evaluated the model on two different target populations, 41,381 patients who presented with SARS-CoV-2 at an outpatient or emergency department visit and 9,429,285 patients who presented with influenza or related symptoms during an outpatient or emergency department visit, to predict their risk of hospitalization with pneumonia during the following 0-30 days. In total, we validated the model across a network of 14 databases spanning the United States, Europe, Australia, and Asia. RESULTS: The internal validation performance of the C-19 index had a C statistic of 0.73, and the calibration was not reported by the authors. When we externally validated it by transporting it to SARS-CoV-2 data, the model obtained C statistics of 0.36, 0.53 (0.473-0.584) and 0.56 (0.488-0.636) on Spanish, US, and South Korean data sets, respectively. The calibration was poor, with the model underestimating risk. When validated on 12 data sets containing influenza patients across the OHDSI network, the C statistics ranged between 0.40 and 0.68. CONCLUSIONS: Our results show that the discriminative performance of the C-19 index model is low for influenza cohorts and even worse among patients with COVID-19 in the United States, Spain, and South Korea. These results suggest that C-19 should not be used to aid decision-making during the COVID-19 pandemic. Our findings highlight the importance of performing external validation across a range of settings, especially when a prediction model is being extrapolated to a different population. In the field of prediction, extensive validation is required to create appropriate trust in a model.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,019
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,151
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,019
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,128
Tête enseignante GPT0,582
Écart entre enseignants0,454 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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