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Enregistrement W3135275361 · doi:10.1093/jamiaopen/ooab012

Evaluating the utility of synthetic COVID-19 case data

2021· article· en· W3135275361 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueJAMIA Open · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiquePrivacy-Preserving Technologies in Data
Établissements canadiensChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCompute Canada
Mots-clésProxy (statistics)Confidence intervalSynthetic dataComputer scienceMissing dataData miningCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Data setComorbidityStatisticsMedicineArtificial intelligenceMachine learningMathematicsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Concerns about patient privacy have limited access to COVID-19 datasets. Data synthesis is one approach for making such data broadly available to the research community in a privacy protective manner. OBJECTIVES: Evaluate the utility of synthetic data by comparing analysis results between real and synthetic data. METHODS: A gradient boosted classification tree was built to predict death using Ontario's 90 514 COVID-19 case records linked with community comorbidity, demographic, and socioeconomic characteristics. Model accuracy and relationships were evaluated, as well as privacy risks. The same model was developed on a synthesized dataset and compared to one from the original data. RESULTS: The AUROC and AUPRC for the real data model were 0.945 [95% confidence interval (CI), 0.941-0.948] and 0.34 (95% CI, 0.313-0.368), respectively. The synthetic data model had AUROC and AUPRC of 0.94 (95% CI, 0.936-0.944) and 0.313 (95% CI, 0.286-0.342) with confidence interval overlap of 45.05% and 52.02% when compared with the real data. The most important predictors of death for the real and synthetic models were in descending order: age, days since January 1, 2020, type of exposure, and gender. The functional relationships were similar between the two data sets. Attribute disclosure risks were 0.0585, and membership disclosure risk was low. CONCLUSIONS: This synthetic dataset could be used as a proxy for the real dataset.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,117
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Science ouverte
Catégories consensuellesScience ouverte
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,835
Score d'incertitude au seuil0,923

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,117
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0820,441
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,379
Tête enseignante GPT0,474
Écart entre enseignants0,095 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle