MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3135298146 · doi:10.1093/jcag/gwab002.012

A13 A HIGH SALT DIET SYNERGIZES WITH UC MICROBIOTA TO INDUCE A PROINFLAMMATORY IMMUNE TONE IN IMMUNOCOMPETENT GNOTOBIOTIC MICE

2021· article· en· W3135298146 sur OpenAlexaff
Alba Santiago Badenas, Amber Hann, Heather J. Galipeau, Marco Constante, Přemysl Berčík, Elena F. Verdú

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensPopulation Health Research InstituteMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProinflammatory cytokineFecesImmune systemUlcerative colitisColitisSpecific-pathogen-freeImmunologyInflammationFlow cytometryBiologyInflammatory bowel diseasePathogenesisGut floraMicrobiologyInternal medicineMedicineDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background The exact cause for inflammatory bowel disease (IBD) is unknown, however, there is consensus that a combination of genetic, environmental, and immune factors, participate in its pathogenesis. Recently, high salt diet (HSD) has been shown to increase the severity of experimental colitis through depletion of lactobacilli in specific pathogen-free mice. However, whether HSD-microbiota interaction occurs in mice colonized with microbiota from patients with IBD, is unknown. Aims Our aim was to determine whether mice colonized with microbiota from patients with active ulcerative colitis (UC), one of two forms of IBD, develop more severe inflammation when fed a HSD. Methods 10–15 week-old germ-free C57BL/6 mice were colonized with fecal microbiota from a healthy control (HC, n=13) or from a patient with UC experiencing a flare (UC, n=13). Colonized mice were housed in ISO positive cages (Techniplast) in a gnotobiotic facility during the experiment. For each group, half of the mice were kept on a control diet (7004, Teklad) and the other half were fed a HSD (7004 supplemented with 4% NaCl) plus 1% NaCl in drinking water for 3 weeks. At sacrifice, colon tissue was collected for histological analysis, RNA sequencing, and flow cytometry. Fecal samples were collected for lipocalin-2 determination. Results Colonic polymorphonuclear (PMN) cells were higher in UC compared with HC mice, regardless of diet (p<0.01). In mice fed HSD, UC mice also had higher PMN cell counts than HC mice (p<0.001). Administration of HSD to UC, but not to HC mice, also increased the proportion of α4+IFNg-producing T cells in the colonic lamina propria, compared with UC mice fed control diet (p<0.01). This was paralleled by higher fecal lipocalin-2 in UC mice fed HSD compared with control diet (p<0.05). Targeted analysis of RNA sequencing data revealed that 7 genes, mainly related to the JAK/STAT pathway (i.e., Stat2, Tyk2, Tlr7) were differentially expressed (p≤0.05) between HC and UC mice fed the control diet. A different gene expression signature was found in mice fed HSD compared with control diet, with an increase in proinflammatory genes in UC colonized mice compared to HC colonized mice, such as Il12a and Il6 (p<0.05). Conclusions Immunocompetent mice colonized with microbiota from a UC patient in flare spontaneously developed a proinflammatory immune tone, which was exacerbated by HSD. The different pattern of gene induction observed in mice colonized with the microbiota from the same UC donor, but fed HSD, suggests independent and synergistic pathways conducive to inflammation. Future studies will explore the preclinical therapeutic effect of novel drug candidates for the inhibition of such pathways. Funding Agencies CCC

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology→Même sujetGut microbiota and health→Travaux en français237 207→