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Enregistrement W3135673850 · doi:10.3390/cancers13051002

Apoptotic Blocks in Primary Non-Hodgkin B Cell Lymphomas Identified by BH3 Profiling

2021· article· en· W3135673850 sur OpenAlexafffund
Ryan N. Rys, Claudia M. Wever, Dominique Geoffrion, Christophe Gonçalves, Artin Ghassemian, Eugène Brailovski, Jeremy Ryan, Liliana Stoica, Josée Hébert, Tina Petrogiannis‐Haliotis, Svetlana Dmitrienko, Saul Frenkiel, Annette M. Staiger, German Ott, Christian Steidl, David W. Scott, Pierre Sesques, Sonia V. del Rincón, Koren K. Mann, Anthony Letai, Nathalie A. Johnson

Notice bibliographique

RevueCancers · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Lymphocytic Leukemia Research
Établissements canadiensUniversité de MontréalHôpital Maisonneuve-RosemontSpinal Cord Injury BCMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésVenetoclaxMCL1VincristineMantle cell lymphomaCancer researchApoptosisLymphomaChronic lymphocytic leukemiaDoxorubicinB cellFollicular lymphomaMedicineChemistryBiologyChemotherapyLeukemiaImmunologyInternal medicineAntibodyDownregulation and upregulationCyclophosphamideBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To determine causes of apoptotic resistance, we analyzed 124 primary B cell NHL samples using BH3 profiling, a technique that measures the mitochondrial permeabilization upon exposure to synthetic BH3 peptides. Our cohort included samples from chronic lymphocytic leukemia (CLL), follicular lymphoma (FL), diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL), high-grade B cell lymphoma with translocations in MYC and BCL2 (HGBL-DH), mantle cell lymphoma (MCL) and marginal zone lymphoma (MZL). While a large number of our samples displayed appropriate responses to apoptosis-inducing peptides, pro-apoptotic functional defects, implicating BAX, BAK, BIM or BID, were seen in 32.4% of high-grade NHLs (12/37) and in 3.4% of low-grade NHLs (3/87, p < 0.0001). The inhibition of single anti-apoptotic proteins induced apoptosis in only a few samples, however, the dual inhibition of BCL2 and MCL1 was effective in 83% of samples, indicating MCL1 was the most common cause of lack of response to the BCL2 inhibitor, venetoclax. We then profiled Toledo and OCI-Ly8 high-grade lymphoma cell lines to determine which drugs could reduce MCL1 expression and potentiate venetoclax responses. Doxorubicin and vincristine decreased levels of MCL1 and increased venetoclax-induced apoptosis (all p < 0.05). Overall, in primary NHLs expressing BCL2 that have no defects in pro-apoptotic signaling, a poor response to venetoclax is primarily due to the presence of MCL1, which may be overcome by combining venetoclax with doxorubicin and vincristine-based chemotherapy or with other anti-microtubule inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,090
Score d'incertitude au seuil0,961

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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