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Enregistrement W3136939712 · doi:10.1002/cmdc.202100107

A Series of 2‐((1‐Phenyl‐1H‐imidazol‐5‐yl)methyl)‐1H‐indoles as Indoleamine 2,3‐Dioxygenase 1 (IDO1) Inhibitors

2021· article· en· W3136939712 sur OpenAlexafffund
Yong Zheng, Paul M. Stafford, Kurt R. Stover, Darapaneni Chandra Mohan, Mayuri Gupta, Eric C. Keske, Paolo Schiavini, Laura Villar, Fan Wu, Alexander Kreft, Kiersten Thomas, Elana Raaphorst, Jagadeesh Prasad Pasangulapati, Siva R. Alla, Simmi Sharma, Irina K. Sagamanova, Shea L. Johnson, Mark A. Reed, Donald F. Weaver

Notice bibliographique

RevueChemMedChem · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueTryptophan and brain disorders
Établissements canadiensUniversity of TorontoKrembil FoundationUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchKrembil Foundation
Mots-clésChemistryPenetrant (biochemical)Indoleamine 2,3-dioxygenaseDocking (animal)PharmacologyIndole testStereochemistryStructure–activity relationshipCombinatorial chemistryBiochemistryMedicineIn vitroTryptophanOrganic chemistryAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Indoleamine 2,3‐dioxygenase 1 (IDO1) is a promising therapeutic target in cancer immunotherapy and neurological disease. Thus, searching for highly active inhibitors for use in human cancers is now a focus of widespread research and development efforts. In this study, we report the structure‐based design of 2‐(5‐imidazolyl)indole derivatives, a series of novel IDO1 inhibitors which have been designed and synthesized based on our previous study using N1‐substituted 5‐indoleimidazoles. Among these, we have identified one with a strong IDO1 inhibitory activity (IC50=0.16 μM, EC50=0.3 μM). Structural‐activity relationship (SAR) and computational docking simulations suggest that a hydroxyl group favorably interacts with a proximal Ser167 residue in Pocket A, improving IDO1 inhibitory potency. The brain penetrance of potent compounds was estimated by calculation of the Blood Brain Barrier (BBB) Score and Brain Exposure Efficiency (BEE) Score. Many compounds had favorable scores and the two most promising compounds were advanced to a pharmacokinetic study which demonstrated that both compounds were brain penetrant. We have thus discovered a flexible scaffold for brain penetrant IDO1 inhibitors, exemplified by several potent, brain penetrant, agents. With this promising scaffold, we provide herein a basis for further development of brain penetrant IDO1 inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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