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Enregistrement W3137641233 · doi:10.1128/mbio.00294-21

Effect of HIV/HAART and Other Clinical Variables on the Oral Mycobiome Using Multivariate Analyses

2021· article· en· W3137641233 sur OpenAlex
Paul L. Fidel, Zach A. Thompson, Elizabeth A. Lilly, Carolina Granada, Kelly Treas, Kenneth R. Dubois, Laura Beth Cook, Shahr B. Hashmi, Daniel J. Lisko, Chiranjit Mukherjee, José A. Vázquez, Michael E. Hagensee, Ann L. Griffen, Eugene J. Leys, Clifford J. Beall

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuemBio · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV/AIDS oral health manifestations
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésInternal transcribed spacerBiologyMalasseziaFirmicutesMicrobiologyBacteroidetesCandida dubliniensisActinobacteriaCandida albicansRibosomal RNACorpus albicans16S ribosomal RNABacteriaGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The oral microbiome is likely a key element of homeostasis in the oral cavity. With >600 bacterial species and >160 fungal species comprising the oral microbiome, influences on its composition can have an impact on both local and systemic health. We recently reported significant effects of HIV and several other clinical variables on the oral bacterial community in a large cohort of HIV-positive and -negative subjects. We describe here a comprehensive analysis of the oral mycobiome in the same cohort. Similar to the bacterial community, HIV under highly active antiretroviral therapy (HAART) had a significant impact on the mycobiome composition, but with less impact compared to other clinical variables. Additionally, unlike the oral bacterial microbiome, the oral mycobiome is often dominated by a single species with 4 major clusters of fungal communities. Together, these results suggest the oral mycobiome has distinct properties compared with the oral bacterial community, although both are equally impacted by HIV.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,192
Score d'incertitude au seuil0,247

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,183
Tête enseignante GPT0,500
Écart entre enseignants0,317 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle