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Enregistrement W3138750498 · doi:10.1016/j.stemcr.2021.03.001

One-step Reprogramming of Human Fibroblasts into Oligodendrocyte-like Cells by SOX10, OLIG2, and NKX6.2

2021· article· en· W3138750498 sur OpenAlexaff
Konstantina Chanoumidou, Benjamín Hernández-Rodríguez, Farina Windener, Christian Thomas, Martin Stehling, Sabah Mozafari, Stefanie Albrecht, Linda Ottoboni, Jack P. Antel, Kee-Pyo Kim, Sergiy Velychko, Qiao Ling Cui, Yu Kang T. Xu, Gianvito Martino, Jürgen Winkler, Hans R. Schöler, Anne Baron‐Van Evercooren, Odile Boespflug‐Tanguy, Juan M. Vaquerizas, Marc Ehrlich, Tanja Kuhlmann

Notice bibliographique

RevueStem Cell Reports · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurogenesis and neuroplasticity mechanisms
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesSeventh Framework ProgrammeMedical Research CouncilMax-Planck-GesellschaftDeutsche ForschungsgemeinschaftInterdisziplinäres Zentrum für Klinische Forschung, Universitätsklinikum WürzburgFrench Muscular Dystrophy AssociationAgence Nationale de la RechercheHorizon 2020NovartisNational Multiple Sclerosis Society
Mots-clésOLIG2BiologySOX10RemyelinationOligodendrocyteReprogrammingCell biologyMyelinDNA methylationCancer researchNeuroscienceGeneticsGene expressionCellGeneCentral nervous systemEmbryo

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Limited access to human oligodendrocytes impairs better understanding of oligodendrocyte pathology in myelin diseases. Here, we describe a method to robustly convert human fibroblasts directly into oligodendrocyte-like cells (dc-hiOLs), which allows evaluation of remyelination-promoting compounds and disease modeling. Ectopic expression of SOX10, OLIG2, and NKX6.2 in human fibroblasts results in rapid generation of O4 + cells, which further differentiate into MBP + mature oligodendrocyte-like cells within 16 days. dc-hiOLs undergo chromatin remodeling to express oligodendrocyte markers, ensheath axons, and nanofibers in vitro , respond to promyelination compound treatment, and recapitulate in vitro oligodendroglial pathologies associated with Pelizaeus-Merzbacher leukodystrophy related to PLP1 mutations. Furthermore, DNA methylome analysis provides evidence that the CpG methylation pattern significantly differs between dc-hiOLs derived from fibroblasts of young and old donors, indicating the maintenance of the source cells' "age." In summary, dc-hiOLs represent a reproducible technology that could contribute to personalized medicine in the field of myelin diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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