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Enregistrement W3139002832 · doi:10.1101/2021.03.17.435827

Distance decay 2.0 – a global synthesis of taxonomic and functional turnover in ecological communities

2021· preprint· en· W3139002832 sur OpenAlexaff
Caio Graco‐Roza, Sonja Aarnio, Nerea Abrego, Alicia Teresa Rosario Acosta, Janne Alahuhta, Jan Altman, Claudia Angiolini, Jukka Aroviita, Fabio Attorre, Lars Baastrup‐Spohr, José Juan Barrera-Alba, Jonathan Belmaker, Idoia Biurrun, Gianmaria Bonari, Helge Bruelheide, Sabina Burrascano, Marta Carboni, Pedro Cardoso, José C. Carvalho, Giuseppe Castaldelli, Morten Christensen, Gilsineia Corrêa, Iwona Dembicz, Jürgen Dengler, Jiří Doležal, Patrícia Domingos, Tibor Erős, Carlos Eduardo Leite Ferreira, Goffredo Filibeck, Sergio R. Floeter, Alan M. Friedlander, Johanna Gammal, Anna Gavioli, Martin M. Goßner, Itai Granot, Riccardo Guarino, Camilla Gustafsson, Brian Hayden, Siwen He, Jacob Heilmann‐Clausen, Jani Heino, John T. Hunter, Vera L. M. Huszar, Monika Janišová, Jenny Jyrkänkallio‐Mikkola, Kimmo K. Kahilainen, Julia Kemppinen, Łukasz Kozub, Carla Kruk, Michel Kulbiki, Анна Куземко, Peter C. le Roux, Aleksi Lehikoinen, Domênica Teixeira de Lima, Angel Lopes-Urrutia, Balázs Lukács, Miska Luoto, Stefano Mammola, Marcelo Manzi Marinho, Luciana da Silva Menezes, Marco Milardi, Marcela Miranda, Gleyci Aparecida Oliveira Moser, Joerg Mueller, Pekka Niittynen, Alf Norkko, Arkadiusz Nowak, Jean Pierre Ometto, Otso Ovaskainen, Gerhard E. Overbeck, F. Pacheco, Virpi Pajunen, Salza Palpurina, Félix Picazo, Juan Antonio Campos, Iván F. Rodil, Francesco María Sabatini, Shira Salingré, Michele De Sanctis, Ángel M. Segura, Lúcia Helena Sampaio da Silva, Z. D. Stevanović, Grzegorz Swacha, Anette Teittinen, Kimmo Tolonen, Ioannis Tsiripidis, Leena Virta, Beixin Wang, Jianjun Wang, Wolfgang W. Weisser, Yuan Xu, Janne Soininen

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEcology and Vegetation Dynamics Studies
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesDeutsches Zentrum für integrative Biodiversitätsforschung Halle-Jena-LeipzigFundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de JaneiroCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésDistance decayBeta diversityLatitudeSpatial ecologyEcosystemOrdinationEcologyGeographical distanceSpatial heterogeneitySimilarity (geometry)Exponential decaySpatial variabilityBiodiversityEnvironmental scienceBiologyGeographyMathematicsStatisticsComputer sciencePhysicsArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Understanding the variation in community composition and species abundances, i.e., β-diversity, is at the heart of community ecology. A common approach to examine β-diversity is to evaluate directional turnover in community composition by measuring the decay in the similarity among pairs of communities along spatial or environmental distances. We provide the first global synthesis of taxonomic and functional distance decay along spatial and environmental distance by analysing 149 datasets comprising different types of organisms and environments. We modelled an exponential distance decay for each dataset using generalized linear models and extracted r 2 and slope to analyse the strength and the rate of the decay. We studied whether taxonomic or functional similarity has stronger decay across the spatial and environmental distances. We also unveiled the factors driving the rate of decay across the datasets, including latitude, spatial extent, realm, and organismal features. Taxonomic distance decay was stronger along spatial and environmental distances compared with functional distance decay. The rate of taxonomic spatial distance decay was the fastest in the datasets from mid-latitudes while the rate of functional decay increased with latitude. Overall, datasets covering larger spatial extents showed a lower rate of decay along spatial distances but a higher rate of decay along environmental distances. Marine ecosystems had the slowest rate of decay. This synthesis is an important step towards a more holistic understanding of patterns and drivers of taxonomic and functional β-diversity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,023
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,043

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,023
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0060,006
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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