Isolation and re-connection: the formation of a ring-shaped speciation continuum in an odorous frog (Odorrana margaretae)
Notice bibliographique
Résumé
The Green Odorous Frog (Odorrana margaretae) around the Sichuan Basin of western China displays a ring-shaped distributional pattern and possesses multiple replicate contact zones between lineages at various levels of differentiation. To understand its unique speciation history and mechanisms, we obtained 1,540 SNPs from 29 populations and 227 individuals using ddRAD sequencing. Population structure analysis revealed three groups within the species: The West, the North & South, and the East groups. These groups were initially isolated at ~2.03 million years ago, and subsequent post-glacial expansion produced the current ring-shaped distribution around Sichuan Basin with three contact zones. Hybridization in those zones involved lineages with different levels of divergence and produced greatly different outcomes. Both the hybrid zones at southwest (S-W) and southeast (E-NS) of the Basin have extensive admixture and less barrier effect. Consequently, the southern region has the highest genetic diversity and becomes an ‘evolutionary melting pot’. In contrast, the hybrid zone at northwestern corner (N-W), which resembles the overlap zone between two expansion terminals of a ring species, has limited admixture with a narrow geographic cline, suggesting partial reproductive isolation between the northern and western populations. The three hybrid zones likely resemble three time points along a speciation continuum; while both E-NS and S-W hybrid zones are merging, the N-W zone may have passed the ‘tipping point’ and is destined for a complete reproductive isolation over time.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».