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Enregistrement W3143638314 · doi:10.1002/1878-0261.12954

The evolutionarily conserved long non‐coding RNA <i>LINC00261</i> drives neuroendocrine prostate cancer proliferation and metastasis <i>via</i> distinct nuclear and cytoplasmic mechanisms

2021· article· en· W3143638314 sur OpenAlexaff
Rebecca Mather, Abhijit Parolia, Sandra E. Carson, Erik Venalainen, David Roig-Carles, Mustapha Jaber, Shih‐Chun Chu, Ilaria Alborelli, Rebecca Wu, Dong Lin, Noushin Nabavi, Elena Jachetti, Mario P. Colombo, Hui Xue, Perla Pucci, Xinpei Ci, Cheryl A. Hawkes, Yinglei Li, Hardev Pandha, Igor Ulitsky, Crystal N. Marconett, Luca Quagliata, Wei Jiang, Ignacio A. Romero, Yuzhuo Wang, Francesco Crea

Notice bibliographique

RevueMolecular Oncology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensVancouver General HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCancer Research UK
Mots-clésDownregulation and upregulationBiologyGene knockdownCancer researchMetastasisProstate cancerLong non-coding RNACell biologyGeneCancerGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Metastatic neuroendocrine prostate cancer (NEPC) is a highly aggressive disease, whose incidence is rising. Long noncoding RNAs (lncRNAs) represent a large family of disease‐ and tissue‐specific transcripts, most of which are still functionally uncharacterized. Thus, we set out to identify the highly conserved lncRNAs that play a central role in NEPC pathogenesis. To this end, we performed transcriptomic analyses of donor‐matched patient‐derived xenograft models (PDXs) with immunohistologic features of prostate adenocarcinoma (AR + /PSA + ) or NEPC (AR − /SYN + /CHGA + ) and through differential expression analyses identified lncRNAs that were upregulated upon neuroendocrine transdifferentiation. These genes were prioritized for functional assessment based on the level of conservation in vertebrates. Here, LINC00261 emerged as the top gene with over 3229‐fold upregulation in NEPC. Consistently, LINC00261 expression was significantly upregulated in NEPC specimens in multiple patient cohorts. Knockdown of LINC00261 in PC‐3 cells dramatically attenuated its proliferative and metastatic abilities, which are explained by parallel downregulation of CBX2 and FOXA2 through distinct molecular mechanisms. In the cell cytoplasm, LINC00261 binds to and sequesters miR‐8485 from targeting the CBX2 mRNA, while inside the nucleus, LINC00261 functions as a transcriptional scaffold to induce SMAD‐driven expression of the FOXA2 gene. For the first time, these results demonstrate hyperactivation of the LINC00261‐ CBX2‐FOXA2 axes in NEPC to drive proliferation and metastasis, and that LINC00261 may be utilized as a therapeutic target and a biomarker for this incurable disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,162
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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