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Enregistrement W3148789150 · doi:10.22215/etd/2013-09957

Interactions of BLADE-ON-PETIOLE1 and 2 with TALE Homeobox Genes in the Regulation of Flowering and Inflorescence Architecture in Arabidopsis Thaliana

2013· dissertation· en· W3148789150 sur OpenAlexaff
Madiha Khan

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHomeoboxInflorescenceMeristemBiologyArabidopsisArabidopsis thalianaTranscription factorGeneticsGeneCell biologyBotanyMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plants have evolved a diversity of inflorescence architectures and variations in flowering time to maximize reproductive success within their environment. BLADE-ON-PETIOLE 1, 2 (BOP1/2) are a class of BTB-ankryin transcription factors. BOP activity is concentrated at meristem-organ junctions (“lateral organ boundaries”) where it functions to control the morphology of leaves, flowers, fruits, and inflorescences.Gain-of-function BOP1/2 plants mimic loss-of-function in KNOX and BELL three-amino-acid-loop extension (TALE) homeodomain proteins. BEL1-like (BELL) genes PENNYWISE (PNY) andPOUNDFOOLISH (PNF) are required for Arabidopsis thaliana competence to flower, whereas the KNOTTED1-like HOMEOBOX (KNOX) gene BREVIPEDICELLUS (BP) in conjunction with PNY control internode elongation and stem patterning in inflorescences. In this thesis, I used BOP gain-of-function as an approach to uncover interactions with TALE homeobox genes in regulation of flowering and inflorescence architecture.Firstly, I showed that BP/PNY in stems and PNY/PNF in meristems restrict BOP1/2 expression to boundaries to promote flowering, internode elongation and vascular patterning. Secondly, I identified lateral organ boundary genes KNOTTED-like from ARABIDOPSIS THALIANA6 (KNAT6) and ARABIDOPSIS THALIANA HOMEBOX GENE1 (ATH1) as required by BOP1/2 to antagonize BP/PNY activity through reciprocal regulation of downstream target genes, including biosynthetic enzymes required for lignin deposition in stems. Lastly, BOP1/2 lack a DNA-binding domain and associate with promoter DNA by binding to TGACG (TGA) bZIP transcription factors. I identified TGA1 and TGA4 bZIP factors required by BOP1/2 to exert changes in flowering and inflorescence architecture.Collectively, these findings shed light on how interplay between BOP1/2 and KNOX-BELL complexes in the meristem and lateral organ boundaries governs flowering and inflorescence architecture in a model plant species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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