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Enregistrement W3152925158 · doi:10.1101/2021.04.15.439909

XBP1s-Mediated ER Proteostasis Network Enhancement Can Selectively Improve the Folding and Secretion of an Osteogenesis Imperfecta-Causing Collagen-I Variant

2021· preprint· en· W3152925158 sur OpenAlexfundno aff
Andrew S. DiChiara, Ngoc‐Duc Doan, Agata A. Bikovtseva, Lynn Rowley, Vincent L. Butty, MaryAnn E. Weis, David R. Eyre, Shireen R. Lamandé, John F. Bateman, Matthew D. Shoulders

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilNational Institute of Environmental Health SciencesG. Harold and Leila Y. Mathers FoundationCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthNational Health and Medical Research CouncilState Government of VictoriaCamille and Henry Dreyfus Foundation
Mots-clésProteostasisUnfolded protein responseSecretionEndoplasmic reticulumOsteogenesis imperfectaCell biologyChemistryType I collagenProtein foldingXBP1Procollagen peptidaseMutantSecretory proteinMolecular biologyBiologyBiochemistryGeneEndocrinologyAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Osteogenesis imperfecta (OI) is typically caused by autosomal dominant mutations in genes encoding collagen type-I, most commonly resulting in Gly→Ser triple-helical domain substitutions that disrupt collagen folding and/or stability. Here, we test the hypothesis that upregulating the endoplasmic reticulum (ER) proteo-stasis network via the unfolded protein response (UPR) can improve the folding and secretion of the clinically severe, prototypical OI-causing COL1A1 p.G425S collagen-α1(I) variant. We first show that small molecules that activate the entire UPR by causing global ER protein misfolding stress severely ablate collagen-I secretion from both G425S Colα1(I)- and wild-type (WT) Colα1(I)-expressing primary fibroblasts. In contrast, stress-independent, specific induction of just the UPR’s XBP1s transcriptional response can enhance collagen-I secretion from G425S Colα1(I) patient primary fibroblasts up to ~300% of basal levels. Notably, the effect is selective – collagen-I secretion from WT Colα1(I)-expressing healthy donor primary fibroblasts is unaltered by XBP1s. XBP1s pathway activation appears to post-translationally enhance the folding/assembly and secretion of G425S Colα1(I), as only modest impacts on collagen-I transcription or synthesis are observed. Consistent with this notion, we find that the stable, triple-helical collagen-I secreted by XBP1s-activated G425S α1(I) patient fibroblasts includes a higher proportion of the mutant α1(I) polypeptide than the collagen-I secreted under basal ER proteostasis conditions. We note that consistent reproducibility of these results is dependent on as yet unascertained experimental variables. Still, these promising observations suggest the potential for ER proteo-stasis network modulation to improve mutant collagen proteostasis in the collagenopathies, motivating further investigation of the effect’s generality, underlying mechanism, and potential therapeutic benefits.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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