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Enregistrement W3153122599 · doi:10.24908/iqurcp.10734

Why is that Plant Bald? A Study of pAG51 mutant Arabidopsis thaliania

2018· article· en· W3153122599 sur OpenAlexvenueno aff
Evelyn Popiel

Notice bibliographique

RevueInquiry Queen s Undergraduate Research Conference Proceedings · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Reproductive Biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTrichomeMutantBiologyArabidopsisArabidopsis thalianaGeneGeneticsPhenotypeGenetic screenCandidate geneMutationReverse geneticsCell biologyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Trichomes, the unicellular hair-like projections found on the leaves of plants, present an ideal system for the study of cell fate and morphogenesis for biologists. They are easily accessible on the epidermis of plant leaves, they are good candidates for genetic manipulation, and they display easily identifiable mutant phenotypes. In addition to their utility as a model study system, trichomes have a variety of important functions in plants, including defence against insects and pathogens, reduction of water loss, and increased resistance to stress. This study will attempt to further characterize the trichome development pathway through the study of a mutant line of Arabidopsis thaliana that does not develop trichomes on its leaves. I hypothesize that one of the genes near the mutation site in pAG51 has decreased expression, and that this is the cause of the mutant’s trichome-less appearance. To test my hypothesis, I will first assess the transcript levels of the genes near the mutation site using a technique called Quantitative Polymerase Chain Reaction (QPCR). Once a gene has been identified, its function will be tested in vivo. The candidate gene will be knocked out in wild type A. thaliana, and if the progeny of this plant grow without trichomes, this will confirm the function of the candidate gene in trichome formation. Finally mutant pAG51 will be bred with another line of mutant A. thaliana, and the progeny phenotypes will be observed to understand how the candidate gene interacts with other genes in the trichome initiation pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,111
Tête enseignante GPT0,362
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
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Résumé présentoui

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