Pannexin 1 Influences Lineage Specification of Human iPSCs
Notice bibliographique
Résumé
Every single cell in the body communicates with nearby cells to locally organize activities with their neighbors and dysfunctional cell-cell communication can be detrimental during cell lineage commitment, tissue patterning and organ development. Pannexin channels (PANX1, PANX2, and PANX3) facilitate purinergic paracrine signaling through the passage of messenger molecules out of cells. PANX1 is widely expressed throughout the body and has recently been identified in human oocytes as well as 2 and 4-cell stage human embryos. Given its abundance across multiple adult tissues and its expression at the earliest stages of human development, we sought to understand whether PANX1 impacts human induced pluripotent stem cells (iPSCs) or plays a role in cell fate decisions. Western blot, immunofluorescence and flow cytometry reveal that PANX1 is expressed in iPSCs as well as all three germ lineages derived from these cells: ectoderm, endoderm, and mesoderm. PANX1 demonstrates differential glycosylation patterns and subcellular localization across the germ lineages. Using CRISPR-Cas9 gene ablation, we find that loss of PANX1 has no obvious impact on iPSC morphology, survival, or pluripotency gene expression. However, PANX1 gene knockout iPSCs exhibit apparent lineage specification bias under 3-dimensional spontaneous differentiation into the three germ lineages. Indeed, loss of PANX1 increases representation of endodermal and mesodermal populations in PANX1 knockout cells. Importantly, PANX1 knockout iPSCs are fully capable of differentiating toward each specific lineage when exposed to the appropriate external signaling pressures, suggesting that although PANX1 influences germ lineage specification, it is not essential to this process.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».