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Enregistrement W3155243679

Modifying the Stripe Rust Resistance Gene Yr10 in Wheat (Triticum aestivum L.) by PCR Mutagenesis

2018· article· en· W3155243679 sur OpenAlexaff
Darren Van Essen, Michele Frick, André Laroche

Notice bibliographique

RevueURSCA Proceedings · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of Lethbridge
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneBiologyGeneticsR geneMutagenesisTransformation (genetics)Plant disease resistanceStripe rustMutation
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Stripe rust is a disease in cereal crops caused by the fungal pathogen Puccinia striiformis which can have devastating effects on crop yields. Cereal plants have unique resistance (R) genes which code for resistance (R) proteins with coiled coil (CC), nucleotide binding site (NBS), and leucine rich repeat (LRR) domains. The CC and LRR domains are thought to be particularly important for protein function/interaction in the resistance response. The Yr10 gene is a stripe rust resistance gene in Triticum aestivum that codes for a unique CC-NBS-LRR sequence but no longer confers resistance to some races of rust. Previous studies indicate that by mutagenizing the DNA sequences that code for the CC and LRR domains it is possible to change the R protein’s sequence, and possibly the interaction during the resistance response3. Thus, the defeated R genes can confer resistance once again when mutagenized in these regions. This study used PCR mutagenesis (by overlap extension) to mutagenize the Yr10 gene in the regions encoding the CC and LRR domains. Primers were designed to amplify Yr10 such that products contained mutated sequence as extensions, available for overlap. The amplifications were the expected size, indicted primers were successful. The PCR products containing the mutagenized sequences of Yr10 were then assembled with the pANIC 6D vector to be used in further experiments involving the transformation of wheat crops to test resistance. *Indicates presenter

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,465
Score d'incertitude au seuil0,287

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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