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Enregistrement W3156031737 · doi:10.1038/s41420-021-00458-4

Necroptosis in ALS: a hot topic in-progress

2021· article· en· W3156031737 sur OpenAlexafffund
Mathilde Chevin, Guillaume Sébire

Notice bibliographique

RevueCell Death Discovery · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchChildren's Hospital FoundationFondation de l'Hôpital de Montréal pour enfantsGovernment of CanadaFondation des EtoilesRégion Auvergne-Rhône-Alpes
Mots-clésNecroptosisBiologyProgrammed cell deathApoptosisGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Interest in potential implications of necroptosis (Fig. 1 )—i.e., a recently uncovered programmed cell death pathway—in neurodegenerative diseases has been growing over the recent years 1 , 2 . However, very few studies addressed its role in amyotrophic lateral sclerosis (ALS). Dominguez et al. 3 recently brought some negative findings on this topic: (i) the genetic inactivation of receptor-interacting protein kinase (RIPK)1 did not protect against motor neuron degeneration in the superoxide dismutase (SOD)1 model of ALS and (ii) phosphorylated (p)-RIPK1 did not accumulate in the spinal cords of ALS compared to non-ALS patients. These findings raise doubts about the implication of necroptosis in the pathophysiology of ALS. In contrast, other studies detected robust activation of RIPK1, RIPK3, and mixed lineage kinases domain-like (MLKL) proteins in preclinical as well as clinical studies of ALS 4 , 5 , 6 , 7 . The discrepancies between these studies 4 , 5 and others 3 , 8 might be explained by (i) the use of western blotting in whole-tissue extracts 4 , 5 , 8 versus in situ immunolabelling targeting motor neurons 7 , (ii) the removal of circulating blood cells—a rich source of necroptotic markers 9 —in some studies but not in others, (iii) the various time frame of tissue sampling, which matches or not the transient expression of necroptotic markers 10 , or (iv) technical limitations in the availability and specificity of in vivo tools of detection of necroptotic markers 3 , 4 , 5 , 7 , 8 . Fig. 1: Schematic overview of necroptotic cell death. Necroptosis is triggered by inflammatory mediators, including TNF-α and FasL. Upon the recruitment of adapter proteins, the phosphorylation of RIPK1 is induced. The necrosome is composed of interaction and activation (i.e. phosphorylation) of RIPK1, RIPK3, and MLKL. Necroptosis of the cell is induced by mitochondrial fission through interaction of MLKL with mitochondrial phosphatase PGAM5 and Drp1 recruitment. Phosphorylated MLKL also triggers cell death through the disruption of the plasma membrane integrity 1 , 2 . Other mechanisms by which MLKL induces cell death remains to be elucidated. Pharmacological or genetic modulations ( ⊥ ) of necroptosis signaling can target RIPK1, RIPK3, MLKL, as well as their phosphorylated forms 12 , 13 , 14 . Drp1 dynamin-related protein 1, FADD Fas-associated protein with Death Domain, Fas-L Fas-ligand, MLKL mixed lineage kinases domain-like, p phosphorylated, PGAM5 phosphoglycerate mutase family member 5, RIPK receptor-interacting protein kinases, TNFα tumor necrosis factor α, TNFR1 tumor necrosis factor receptor 1, TRADD tumor necrosis factor receptor type 1-associated death. Full size image

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,028

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,001
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0060,011
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0080,007
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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