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Enregistrement W3156358523 · doi:10.3390/biology10040328

Haslea silbo, A Novel Cosmopolitan Species of Blue Diatoms

2021· article· en· W3156358523 sur OpenAlexafffund
Romain Gastineau, Gert H. Hansen, Michel Poulin, Claude Lemieux, Monique Turmel, Jean‐François Bardeau, Vincent Leignel, Yann Hardivillier, Michèle Morançais, Joël Fleurence, Pierre Gaudin, Vona Méléder, Eileen J. Cox, Н. А. Давидович, Olga I. Davidovich, Andrzej Witkowski, Irena Kaczmarska, James M. Ehrman, Emilio Soler Onís, Antera Martel Quintana, Maja Mucko, Solenn Mordret, Diana Sarno, Boris Jacquette, Charlotte Falaise, Julie Séveno, Niels Lindquist, Philip S. Kemp, Elif Eker‐Develi, Merve Konucu, Jean‐Luc Mouget

Notice bibliographique

RevueBiology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueDiatoms and Algae Research
Établissements canadiensUniversité LavalMount Allison UniversityCanadian Museum of Nature
Organismes subventionnairesMinistry of Science and Higher Education of the Russian FederationSeventh Framework ProgrammeStazione Zoologica Anton DohrnNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaEuropean CommissionHrvatska Zaklada za ZnanostCanadian Museum of Nature
Mots-clésBiologyPseudogeneGenomeGeneticsPlasmidPlastidPhylogenetic treeORFSGeneEvolutionary biologyOpen reading frame

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Specimens of a new species of blue diatoms from the genus Haslea Simonsen were discovered in geographically distant sampling sites, first in the Canary Archipelago, then North Carolina, Gulf of Naples, the Croatian South Adriatic Sea, and Turkish coast of the Eastern Mediterranean Sea. An exhaustive characterization of these specimens, using a combined morphological and genomic approach led to the conclusion that they belong to a single new to science cosmopolitan species, Haslea silbo sp. nov. A preliminary characterization of its blue pigment shows similarities to marennine produced by Haslea ostrearia, as evidenced by UV–visible spectrophotometry and Raman spectrometry. Life cycle stages including auxosporulation were also observed, providing data on the cardinal points of this species. For the two most geographically distant populations (North Carolina and East Mediterranean), complete mitochondrial and plastid genomes were sequenced. The mitogenomes of both strains share a rare atp6 pseudogene, but the number, nature, and positions of the group II introns inside its cox1 gene differ between the two populations. There are also two pairs of genes fused in single ORFs. The plastid genomes are characterized by large regions of recombination with plasmid DNA, which are in both cases located between the ycf35 and psbA genes, but whose content differs between the strains. The two sequenced strains hosts three plasmids coding for putative serine recombinase protein whose sequences are compared, and four out of six of these plasmids were highly conserved.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,058
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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