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Enregistrement W3156753608 · doi:10.1002/rcm.9107

Establishment of the tandem mass spectrometric fingerprints of taxane‐based anticancer compounds

2021· article· en· W3156753608 sur OpenAlexaff
Amir Khajavinia, Azita Haddadi, Anas El‐Aneed

Notice bibliographique

RevueRapid Communications in Mass Spectrometry · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTraditional Chinese Medicine Analysis
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesCollege of Pharmacy
Mots-clésChemistryTandem mass spectrometryMass spectrometryTriple quadrupole mass spectrometerFragmentation (computing)TaxaneIon trapSelected reaction monitoringElectrospray ionizationChromatographyElectrosprayQuadrupole ion trapAnalytical Chemistry (journal)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rationale Compounds in the taxane drug family are among the most successful and effective chemotherapeutic agents used in the treatment of solid tumors, such as breast, ovarian, and prostate cancers. The tandem mass spectrometric (MS/MS) fragmentation behavior of these compounds is described in detail, and a generalized MS/MS fingerprint is established for the first time. Methods Five compounds, namely paclitaxel, docetaxel, cabazitaxel, cephalomannine, and baccatin III, were evaluated. A hybrid quadrupole orthogonal time‐of‐flight (Q‐TOF) mass spectrometer was used to obtain accurate mass measurements, whereas MS/MS and second‐generation MS/MS (MS 3 ) analyses were performed using a triple quadrupole‐linear ion trap mass spectrometer. Both instruments were equipped with an electrospray ionization source operated in the positive ion mode. Results All taxanes showed an abundant singly charged [M + H] + species in the single‐stage analysis with mass accuracies less than 3 ppm. The evaluated compounds exhibited common fragmentation behavior in their MS/MS analysis, which allowed for the production of a universal fragmentation pattern. MS 3 experiments confirmed the genesis of the various product ions proposed in the fragmentation pathway. In addition, diagnostic product ions were originated from a cleavage in the ester bond between the core diterpene ring structure and the side chain. Conclusions Varying functional groups present in these compounds resulted in unique product ions that are specific to each structure. The established MS/MS fingerprints will be used in the near future for identification and for the development of multiple reaction monitoring liquid chromatography–MS/MS quantification methods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,143
Score d'incertitude au seuil0,816

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,008
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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