A comprehensive species sampling sheds light on the molecular phylogenetics of Calothecinae (Poaceae, Pooideae, Poeae): Evidence for a new subtribe and multiple genera within the <i>Chascolytrum</i> clade
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The circumscription of the grass subtribe Calothecinae has undergone several changes since its description. Currently, it comprises Chascolytrum and the recently described genera Laegaardia and Paramochloa. Here we evaluate the circumscription of Calothecinae and the recently proposed infrageneric classification of Chascolytrum based on a phylogeny with more comprehensive taxon and molecular marker sampling than in previous studies. We sampled all Calothecinae genera, all but one Chascolytrum species, two South American Trisetum s.l., and representatives of the subtribes Agrostidinae, Brizinae, Echinopogoninae, Koeleriinae, Phalaridinae, and Torreyochloinae within Poaceae tribe Poeae. We performed Bayesian and Maximum Likelihood analyses of four plastid DNA regions (atpF‐atpH, matK, rps16 intron, and trnL‐trnF) and two nuclear ribosomal regions (ITS and ETS). Our results revealed that neither Calothecinae nor Chascolytrum is monophyletic, as currently recognized, because Trisetum brasiliense and Trisetum bulbosum are nested within Chascolytrum. We include these two Trisetum species in Calothecinae as incertae sedis. Laegaardia and Paramochloa form a clade that is sister to the Chascolytrum + Trisetum clade, and based on morphological characters, we transfer the former to the new subtribe Paramochloinae. Our Chascolytrum phylogeny is better resolved and supported than in previous studies, and based on these results, we divide Chascolytrum into nine genera, including two new ones: Boldrinia (gen. nov.), Calotheca, Chascolytrum, Erianthecium, Lombardochloa, Microbriza, Poidium, Rhombolytrum, and Rosengurttia (gen. nov.). We provide a key to Calothecinae genera, descriptions of the genera, nomenclatural information, and keys to species of each genus. In addition, six new combinations are proposed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».