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Enregistrement W3157127000 · doi:10.1016/j.coph.2021.04.006

Organotypic human ex vivo models for coronavirus disease 2019 research and drug development

2021· review· en· W3157127000 sur OpenAlexfundno aff
Sonia Youhanna, Shane C. Wright, Volker M. Lauschke

Notice bibliographique

RevueCurrent Opinion in Pharmacology · 2021
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesVetenskapsrådetOntario Institute for Cancer ResearchSvenska Sällskapet för Medicinsk ForskningEuropean CommissionMcGill UniversityEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsMerck KGaAKungliga Tekniska HögskolanKnut och Alice Wallenbergs StiftelseEli Lilly and Company
Mots-clésEx vivoVirologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Drug developmentDrugSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)2019-20 coronavirus outbreakCoronavirusDrug discoveryMedicineIn vivoBiologyComputational biologyDiseasePharmacologyBioinformaticsInfectious disease (medical specialty)GeneticsPathologyOutbreak

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Since the discovery of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) in late 2019, intense research efforts on an unprecedented scale have focused on the study of viral entry mechanisms and adaptive immunity. While the identification of angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) and other co-receptors has elucidated the molecular and structural basis for viral entry, the pathobiological mechanisms of SARS-CoV-2 in human tissues are less understood. Recent advances in bioengineering have opened opportunities for the use of organotypic human tissue models to investigate host-virus interactions and test antiviral drug candidates in a physiological context. Although it is too early to accurately quantify the added value of these systems compared with conventional cell systems, it can be assumed that these advanced three-dimensional (3D) models contribute toward improved result translation. This mini-review summarizes recent work to study SARS-CoV-2 infection in human 3D tissue models with an emphasis on the pharmacological tools that have been developed to understand and prevent viral entry and replication.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,447
Tête enseignante GPT0,582
Écart entre enseignants0,135 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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