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Enregistrement W3157495480 · doi:10.24908/iqurcp.8475

7.  Dkk‐1/Ror2 and Wnt5a/Ror2 Production of CDX2: Defining Intestinal Adenocarcinoma

2016· article· en· W3157495480 sur OpenAlexvenueno aff
Jay Jantz

Notice bibliographique

RevueInquiry Queen s Undergraduate Research Conference Proceedings · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDigestive system and related health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésWnt signaling pathwayCDX2Cell biologyCancer researchp38 mitogen-activated protein kinasesWNT5AChemistryProto-oncogene tyrosine-protein kinase SrcSignal transductionMAPK/ERK pathwayBiologyBiochemistryTranscription factorHomeobox

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Wnt signaling regulates cell proliferation and differentiation through ahomeostasis of canonical and noncanonical pathways. Aberrant Wnt signaling induces intestinal adenocarcinoma by promoting stem cell hyperproliferation. In the intestine, Wnt5a binds to its receptor Ror2 to increase the caudal homeobox factor CDX2, a transcriptional activator of intestinal differentiation. Contradictorily, it was also shown that Ror2 alone is overexpressed in adenocarcinoma, and that Ror2 alone will mediate CDX2 increase in vitro. The purpose of this research is to determine how CDX2 is increased by Ror2 alone and Wnt5a/Ror2. Human colon adenocarcinoma cells (HT‐29, SW‐480, and RKO) were used as an in vitro epithelial model. HT‐29 cells constitutively express the signaling protein Dickkopf‐1, whereas SW‐480 and RKO do not. Wnt5a/rhDkk‐1 was used to treat Ror2 or siRor2 transfected cells primed with MAP kinase pharmacological inhibitors. The results show that CDX2 was increased after Ror2 overexpression in HT29, but not RKO/SW480 cells. Further addition of Dkk‐1 to RKO/SW480 cells resulted in CDX2 increase. Pharmacological inhibition of p38 MAPK, casein kinase 1, or Src kinase decreased CDX2 protein ~24% in Dkk‐1/Ror2 cells, while inhibition of JNK, casein kinase 1, or Src kinase in Wnt5a/Ror2 cells decreased CDX2 protein ~35%. The conclusion is that Ror2 increase in CDX2 protein is dependent on Dkk‐1 or Wnt5a. Dkk‐1/Ror2 CDX2 production is mediated by the MAP kinases p38, CK1, and Src. Wnt5a/Ror2 increases in CDX2 require JNK activation, but not p38 MAPK. Different signaling pathways, dependent on the presence of Dkk1/Wnt5a, offer an explanation for the seemingly contradictory increase in Ror2 alone seen in intestinal adenocarcinoma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,686

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
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Résumé présentoui

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