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Enregistrement W3157851091 · doi:10.1080/23802359.2021.1914526

Phylogenetic analysis of the complete mitochondrial genome of the graphic beauty butterfly <i>Baeotus beotus</i> (Doubleday 1849) (Lepidoptera: Nymphalidae: Nymphalinae: Coeini)

2021· article· en· W3157851091 sur OpenAlexafffund
Melanie M. L. Lalonde

Notice bibliographique

RevueMitochondrial DNA Part B · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLepidoptera: Biology and Taxonomy
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Manitoba
Mots-clésNymphalidaeBiologyPhylogenetic treeMitochondrial DNALepidoptera genitaliaSister groupPhylogeneticsStart codonEvolutionary biologyGenomeButterflyGeneticsGeneCladeBotanyEcologyNucleotide

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The graphic beauty butterfly Baeotus beotus (Doubleday 1849) (Nymphalidae: Coeini) is a rare fruit feeding species that inhabits humid tropical forests in Central and South America. Genome skimming by Illumina sequencing allowed assembly of a complete circular mitogenome of 15,131 bp from B. beotus consisting of 80.4% AT nucleotides, 22 tRNAs, 13 protein-coding genes, two rRNAs and a control region in the typical butterfly gene order. Baeotus beotus COX1 features an atypical CGA start codon and COX1, COX2, ND1, and ND4 exhibit incomplete stop codons completed by the addition of 3’ A residues to the mRNA. Bayesian phylogenetic reconstruction places B. beotus as sister to Cyrestis thyodamas (Cyrestini), which is consistent with previous phylogenetic hypotheses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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