Human Leukocyte Antigen-C and Haplotypes: Associations with Resistance and Susceptibility to HIV-1 Infection among Serodiscordant Couples in Nigeria
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT INTRODUCTION The Human Leucocyte Antigen (HLA) class-1 is known to play a significant role in mediating resistance or susceptibility to HIV infection in the clinical course of AIDS. Recent studies have identified HLA-C as a key molecule that affects HIV disease progression. However, the role of HLA class 1 in heterosexual HIV-1 susceptibility or resistance in serodiscordant couples is not known in Nigeria. Therefore, this study evaluated the association between HLA-C susceptibility and resistance in HIV-1 transmission amongst heterosexual serodiscordant couples in Nigeria. METHODS A total of 271 serodiscordant, concordant HIV positive and negative couples who gave informed consent were enrolled into this study. Extracted genomic DNA was sequenced for high resolution HLA-C class 1 genotypes using allele-specific primers (on exons 2 and 3) for HLA-C sequencing and typing. RESULTS The highest frequency distribution of high-resolution HLA-C alleles observed in the HIV positive subjects were: HLA-C*040101 178 (35.0%) followed by C*0701 124 (24.9%) compared with HIV negative subjects: C*040101 108(39.0%) followed by C*0701 64(24.7%). Alleles C*070201 (OR = 4.19, P<0 . 05 ) and C*0804 (OR = 3, P <0.045) were found to be independently associated with HIV-1 susceptibility in the cohort of serodiscordant couples. HLA-C*0802 (OR=0.5. P <0.005) and C*0304 (OR=0.34. P <0.002) were significantly associated with HIV-1 resistance to HIV-1 infection among the cohort. CONCLUSION The result has contributed to the importance of how host HLA-C genetic factors can influence HIV-1 disease susceptibility (HLA-C*070201; C*0804) and resistance (HLA-C*0802; C*0304) in serodiscordant couples. This information may contribute to the development of future effective HIV vaccine in Nigeria.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».