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Enregistrement W3159405380 · doi:10.1085/jgp.202012850

Identification of PUFA interaction sites on the cardiac potassium channel KCNQ1

2021· article· en· W3159405380 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueThe Journal of General Physiology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesEuropean Research CouncilNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCompute CanadaCanadian Institutes of Health ResearchLinköpings UniversitetSvenska Sällskapet för Medicinsk ForskningHorizon 2020 Framework ProgrammeCanada Research ChairsNational Institutes of HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteVetenskapsrådetKillam TrustsAlberta Innovates - Health Solutions
Mots-clésPolyunsaturated fatty acidChemistryBiophysicsPotassium channelAmphiphileIon channelSelectivityHydrophobic effectFatty acidBiochemistryReceptorBiologyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Polyunsaturated fatty acids (PUFAs), but not saturated fatty acids, modulate ion channels such as the cardiac KCNQ1 channel, although the mechanism is not completely understood. Using both simulations and experiments, we find that PUFAs interact directly with the KCNQ1 channel via two different binding sites: one at the voltage sensor and one at the pore. These two amphiphilic binding pockets stabilize the negatively charged PUFA head group by electrostatic interactions with R218, R221, and K316, while the hydrophobic PUFA tail is selectively stabilized by cassettes of hydrophobic residues. The rigid saturated tail of stearic acid prevents close contacts with KCNQ1. By contrast, the mobile tail of PUFA linoleic acid can be accommodated in the crevice of the hydrophobic cassette, a defining feature of PUFA selectivity in KCNQ1. In addition, we identify Y268 as a critical PUFA anchor point underlying fatty acid selectivity. Combined, this study provides molecular models of direct interactions between PUFAs and KCNQ1 and identifies selectivity mechanisms. Long term, this understanding may open new avenues for drug development based on PUFA mechanisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,163

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle