MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3159836411 · doi:10.1016/j.jcmgh.2021.04.017

Fasting Hormones Synergistically Induce Amino Acid Catabolism Genes to Promote Gluconeogenesis

2021· article· en· W3159836411 sur OpenAlexfundno aff
Noga Korenfeld, Maya Finkel, Nufar Buchshtab, Meirav Bar‐Shimon, Meital Charni‐Natan, Ido Goldstein

Notice bibliographique

RevueCellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism, Diabetes, and Cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAzrieli FoundationIsrael Science FoundationAbisch-Frenkel-StiftungInternational Development Research Centre
Mots-clésCatabolismGlucagonEndocrinologyInternal medicineCREBBiologyGluconeogenesisChromatin immunoprecipitationGlucose homeostasisHormoneCorticosteroneInsulinGene expressionBiochemistryGeneTranscription factorMetabolismInsulin resistanceMedicinePromoter

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND & AIMS: Gluconeogenesis from amino acids (AAs) maintains glucose homeostasis during fasting. Although glucagon is known to regulate AA catabolism, the contribution of other hormones to it and the scope of transcriptional regulation dictating AA catabolism are unknown. We explored the role of the fasting hormones glucagon and glucocorticoids in transcriptional regulation of AA catabolism genes and AA-dependent gluconeogenesis. METHODS: We tested the RNA expression of AA catabolism genes and glucose production in primary mouse hepatocytes treated with fasting hormones (glucagon, corticosterone) and feeding hormones (insulin, fibroblast growth factor 19). We analyzed genomic data of chromatin accessibility and chromatin immunoprecipitation in mice and primary mouse hepatocytes. We performed chromatin immunoprecipitation in livers of fasted mice to show binding of cAMP responsive element binding protein (CREB) and the glucocorticoid receptor (GR). RESULTS: Fasting induced the expression of 31 genes with various roles in AA catabolism. Of them, 15 were synergistically induced by co-treatment of glucagon and corticosterone. Synergistic gene expression relied on the activity of both CREB and GR and was abolished by treatment with either insulin or fibroblast growth factor 19. Enhancers adjacent to synergistically induced genes became more accessible and were bound by CREB and GR on fasting. Akin to the gene expression pattern, gluconeogenesis from AAs was synergistically induced by glucagon and corticosterone in a CREB- and GR-dependent manner. CONCLUSIONS: Transcriptional regulation of AA catabolism genes during fasting is widespread and is driven by glucagon (via CREB) and corticosterone (via GR). Glucose production in hepatocytes is also synergistically augmented, showing that glucagon alone is insufficient in fully activating gluconeogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCellular and Molecular Gastroenterology and HepatologyMême sujetMetabolism, Diabetes, and CancerTravaux en français237 207